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谷子种子线虫检测及分析

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为了快速检测谷子种子携带线虫情况并了解不同地区线虫种群的多态性,利用PCR技术对采集自中国谷子主产区不同区域内的99份谷子种子的带线虫情况进行了检测,并分析其不同地区线虫种群的遗传多样性.结果表明,根据贝西滑刃线虫核糖体28S rRNA-D2/D3片段设计的引物对谷子线虫具有高度的特异性和灵敏性,扩增出245 bp的特异性目的片段,对谷子线虫的检测浓度最低为0.125 ng/μL.在99份谷子种子DNA中,有33份种子检测到特异性扩增条带,测序结果表明,所有扩增条带对应序列与线虫28S rRNA序列的相似性达97％以上,进一步说明33份种子携带线虫.重复试验结果表明,阳性种子的带线虫频率介于33.3％ ～100％,且带线虫的谷子种子主要来自春谷区.分析33份阳性样品的28S rRNA片段序列,存在29个变异位点和22种单倍型,其中单倍型AB1为优势单倍型,河北张家口市和内蒙古松山区两地线虫的单倍型遗传多样性最丰富.本研究建立了一种特异性好、灵敏度高的检测谷子种子带线虫的一步PCR方法;谷子线虫病是夏谷区的主要病害,随着谷子春夏谷区的交流,线虫病成为春谷区病害,种子带病可能是主要初侵染源;不同地理来源的线虫28S rRNA序列存在差异,AB1为优势单倍型.
Detection and Analysis of Millet Seeds with Aphelenchoides besseyi

宋振君、李志勇、王永芳、全建章、马继芳、白辉、董志平

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河北省农林科学院 谷子研究所,河北省杂粮重点实验室,国家谷子改良中心,河北 石家庄 050035

河北师范大学 生命科学学院,河北 石家庄 050024

谷子 贝西滑刃线虫 种子带菌 聚合酶链式反应 单倍型

国家自然科学基金河北省农林科学院创新工程国家现代农业产业技术体系河北省农林科学院基本业务费

318728802019-4-2-3CARS-07-13.5-A82018030202

2019

华北农学报
河北,北京,天津,山西,河南,内蒙古六省市农科院农学会

华北农学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.067
ISSN：1000-7091
年,卷(期)：2019.34(4)
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