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核桃JrCOR413基因家族鉴定与表达分析

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为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析.结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅读框为549～804 bp,翻译蛋白范围为182～267个氨基酸,等电点为8.15～9.93,全部为碱性稳定蛋白;含有典型的WCOR413高度保守的结构域.聚类分析发现,该类基因可与拟南芥高度同源,并分为2个亚组.在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrCOR5在2个核桃品种中显著升高,并且在花器官和嫩茎转录表达较高;结合qPCR分析,JrCOR5在冷胁迫48 h显著升高,达到90倍以上.因此,推测JrCOR5可能在核桃响应冷胁迫过程中起到重要作用.本研究结果将为解析核桃JrCOR413基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制研究奠定基础.
Identification and expression analysis of JrCOR413 gene family in walnut

刘凯、李瑶玲、李洋、王红霞、赵书岗、安秀红、张志华

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河北农业大学 园艺学院,河北 保定 071001

河北农业大学 山区研究所/河北省农业工程中心/国家北方山区工程中心,河北 保定 071001

河北农业大学 生命科学学院,河北 保定 071001

河北省农林科学院 植物保护研究所,河北 保定 071001

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核桃 冷胁迫 COR413基因家族 表达分析

国家重点研发计划河北省自然科学基金河北省重点研发计划

2019YFD1001603C201920427021326352D

2022

10.13320/j.cnki.jauh.2022.0020

河北农业大学学报
河北农业大学

河北农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.475
ISSN：1000-1573
年,卷(期)：2022.45(2)
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