中南农业科技2023,Vol.44Issue(10) :13-16.

萝卜SCPL3基因的克隆与生物信息学分析

李紫薇 霍燕琦 徐铭婕 张文静 刘同金
中南农业科技2023,Vol.44Issue(10) :13-16.

萝卜SCPL3基因的克隆与生物信息学分析

李紫薇 1霍燕琦 1徐铭婕 1张文静 1刘同金1
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  • 1. 金陵科技学院园艺园林学院,南京 210000
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摘要

采用RT-PCR技术克隆了萝卜(Raphanus sativus L.)SCPL3基因CDS序列,并对其进行生物信息学分析.结果表明,萝卜SCPL3基因CDS序列全长1434 bp,编码477个氨基酸,分子式为C2493H3762N632O709S21,相对分子质量为 54.6 kD,理论等电点为 6.33,脂肪系数为 81.30,不稳定系数为 39.26,平均亲水值为-0.227,是稳定亲水蛋白;亚细胞定位预测该蛋白最有可能定位于液泡,存在1个信号肽和3个跨膜结构,含有SC族羧肽酶中的S10蛋白家族结构域;系统进化分析表明其与十字花科作物SCPL蛋白同源性较高.

关键词

萝卜(Raphanus/sativus/L.)/SCPL3基因/克隆/生物信息学

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基金项目

国家级大学生创新训练计划项目(202213573030Z)

金陵科技学院科研孵化项目(jitfhxm-202113)

出版年

2023
中南农业科技
湖北省农业科学院畜牧兽医研究所 湖北省畜牧局 湖北省农业科学院农业测试与科技信息中心

中南农业科技

影响因子:0.152
ISSN:
参考文献量4
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