合成生物学2022,Vol.3Issue(1) :6-21.DOI:10.12211/2096-8280.2021-092

进化视角下的定量生物学规律与人工生命合成

An evolutionary perspective on quantitative biological principles and synthetic life design

赵晓宇 张浩 李雪飞 胡政
合成生物学2022,Vol.3Issue(1) :6-21.DOI:10.12211/2096-8280.2021-092

进化视角下的定量生物学规律与人工生命合成

An evolutionary perspective on quantitative biological principles and synthetic life design

赵晓宇 1张浩 2李雪飞 2胡政2
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作者信息

  • 1. 中国科学院深圳先进技术研究院,深圳合成生物学创新研究院,广东 深圳 518055;中国科学院大学,北京 100049
  • 2. 中国科学院深圳先进技术研究院,深圳合成生物学创新研究院,广东 深圳 518055
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摘要

遗传进化是生物系统的一个基本特征,生物系统的结构与功能都是动态变化的,生物通过进化更好地适应环境.定量合成生物学作为一门新兴交叉学科,主要研究如何利用合成系统定量刻画生物学规律,以及基于理性设计和改造人工生命系统来解答生命科学前沿问题.然而,目前掌握的知识还不足以满足理性设计和定量可控的要求.尽管人工生命系统产生于实验室,但其同样受到进化法则的支配,比如突变、遗传漂变、达尔文自然选择等,因此需要利用进化规律帮助设计和构建更加稳定的人工生命系统;反过来,简单、周期短且可控的定量合成生物系统也可帮助研究生物进化原理提供更佳的生物模型,两者相互促进,为更好地探索生命法则提供了理论支撑和技术手段.本文主要综述了目前应用进化原理筛选目标蛋白的连续定向进化方法,总结了利用进化原理提高合成线路稳定性的策略;同时,介绍了用定量合成生物学的手段研究生物进化原理的进展,并提出了基于进化原理的人工生命设计的研究方向.未来合成生物学与进化生物学的融合发展将为精确控制生命系统提供思路和方法,增进合成生物学改善人类可持续发展的应用.

关键词

遗传进化/定量生物学/合成生物学/人工生命系统/群落进化

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基金项目

国家自然科学基金青年基金(32000886)

广东省自然科学基金杰出青年基金(2021B1515020042)

广东省自然科学基金面上项目(2114050001502)

出版年

2022
合成生物学

合成生物学

CSTPCDCSCD北大核心
ISSN:
参考文献量6
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