合成化学2024,Vol.32Issue(5) :393-399.DOI:10.15952/j.cnki.cjsc.1005-1511.23044

阿伐那非潜在基因毒性杂质E的合成及晶体结构

Synthesis and Crystal Structure of The Potentially Genotoxic Impurity E of Avanafil

孙允凯 吴小霞 曹萌 姜东方 刘钊
合成化学2024,Vol.32Issue(5) :393-399.DOI:10.15952/j.cnki.cjsc.1005-1511.23044

阿伐那非潜在基因毒性杂质E的合成及晶体结构

Synthesis and Crystal Structure of The Potentially Genotoxic Impurity E of Avanafil

孙允凯 1吴小霞 2曹萌 3姜东方 4刘钊5
扫码查看

作者信息

  • 1. 常州工学院化工与材料学院,江苏常州 213032;南华大学化学化工学院,湖南衡阳 421001
  • 2. 南华大学化学化工学院,湖南衡阳 421001;嘉实(湖南)医药科技有限公司,湖南长沙 410220
  • 3. 南华大学化学化工学院,湖南衡阳 421001
  • 4. 嘉实(湖南)医药科技有限公司,湖南长沙 410220
  • 5. 常州工学院化工与材料学院,江苏常州 213032;嘉实(湖南)医药科技有限公司,湖南长沙 410220
  • 折叠

摘要

在合成阿伐那非的经典路线中,最后一步反应使用了 EDCI和HOBT作为酸胺缩合剂.HOBT中可能含有肼的残留,存在引入含酰肼结构的潜在致突变性杂质.通过化学方法合成阿伐那非潜在的基因毒性杂质E,即(S)-4-((3-氯-4-甲氧基苄基)氨基)-2-(2-(羟甲基)吡咯烷-1-基)嘧啶-5-羧酸(M6)与硫酸肼经酸胺缩合后得到(S)-4-((3-氯-4-甲氧基苄基)氨基)-2-(2-羟甲基)吡咯烷-1-基)嘧啶-5-碳酰肼(杂质E),产率为20%.利用溶剂挥发法培养杂质E的单晶,用高分辨质谱及核磁共振对其结构进行分析,并通过X-单晶射线衍射分析出杂质E的Flack参数为-0.03(3),确定其绝对构型为S型.

Abstract

In the classical route of the synthesis of avanafil,the last step of the reaction uses EDCI and HOBT as an acid and amine binding agent.HOBT may contain residues of hydrazine,and potential mutagenic impurities containing acylhydrazide structures may be formed.The potentially genotoxic im-purity E(Imp-E)of avanafil,named(S)-4-((3-chloro-4-methoxybenzyl)amino)-2-(2-(hydroxym-ethyl)pyrrolidin-1-yl)pyrimidine-5-carbohydrazide,was synthesized by the reaction between the(S)-4-((3-chloro-4-methoxybenzyl)amino)-2-(2-(hydroxymethyl)pyrrolidin-1-yl)pyrimidine-5-carboxylic acid(M6)and the hydrazine sulfate,yield of 20%.The single crystal of Imp-E was cultivated by sol-vent volatilization method,and its structure was analyzed by high resolution mass spectrometry(HR-MS)and nuclear magnetic resonance spectroscopy(NMR).The Flack parameter of Imp-E was-0.03(3)by X-ray single crystal diffraction analysis,and the absolute configuration of Imp-E was deter-mined as S configuration.

关键词

阿伐那非/杂质/有机合成/晶体结构/绝对构型

Key words

avanafil/impurity/organic synthesis/crystal structure/absolute configuration

引用本文复制引用

基金项目

湖南省自然科学基金(2022JJ80096)

常州工学院项目(YN22039)

出版年

2024
合成化学
四川省化学化工学会 中国科学院成都有机化学研究所

合成化学

CSTPCD
影响因子:0.42
ISSN:1005-1511
参考文献量19
段落导航相关论文