河北渔业2024,Issue(5) :6-10,36.DOI:10.3969/j.issn.1004-6755.2024.05.002

革胡子鲇生长激素基因表达定量PCR分析的引物设计与评估

Primer design and evaluation for quantitative PCR analysis of growth hormone geneexpression in Clarias gariepinus

蓝一 何净慧 王晓梅 王茜
河北渔业2024,Issue(5) :6-10,36.DOI:10.3969/j.issn.1004-6755.2024.05.002

革胡子鲇生长激素基因表达定量PCR分析的引物设计与评估

Primer design and evaluation for quantitative PCR analysis of growth hormone geneexpression in Clarias gariepinus

蓝一 1何净慧 1王晓梅 2王茜2
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作者信息

  • 1. 天津农学院 水产学院,天津 300384
  • 2. 天津农学院 水产学院,天津 300384;天津市水生生态及养殖重点实验室,天津 300384
  • 折叠

摘要

以革胡子鲇(Clarias gariepinus)为试验对象,对其生长激素(GH)基因进行荧光定量 PCR(qPCR)的引物设计与评估.将合成的 5 对引物通过常规 PCR 电泳结果选择出符合条件的 GHF-GHR 引物,并进行qPCR引物的评估.结果显示:扩增 GH 基因片段的引物 GHF-GHR 扩增时熔解曲线为单一峰,说明引物具有良好的特异性;通过标准曲线得出 GHF-GHR引物的扩增效率为 93.3%,标准曲线的 R2 值为 0.982,说明引物的扩增效率良好.上述结果说明 GHF-GHR引物能用于待检样本的 GH 基因表达的 qPCR分析.

Abstract

This experiment focused on the design and evaluation of primers for growth hormone(GH)gene in Clarias gariepinus using fluorescence quantitative PCR(qPCR).Five pairs of primers were synthesized,and the GHF-GHR primer pair was selected based on the results of conventional PCR electrophoresis.Subsequently,the GHF-GHR primer pair was evaluated for qPCR.The results in-dicated that the amplification curve of the GH gene fragment with the GHF-GHR primer pair showed a single peak,demonstrating good specificity of the primers.The amplification efficiency of the GHF-GHR primer pair was determined to be 93.3%based on the standard curve,with an R2 value of 0.982,indicating a high amplification efficiency of the primers.These results suggest that the GHF-GHR primer pair is suitable for qPCR analysis of GH gene expression in the test samples.

关键词

革胡子鲇(Clarias/gariepinus)/生长激素基因/引物设计/荧光定量PCR/评估

Key words

Clarias gariepinus/GH gene/primer design/qPCR/evaluate

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基金项目

国家自然科学基金(31672264)

天津市淡水养殖产业体系创新团队建设项目(ITTFRSA2021000)

出版年

2024
河北渔业
河北省水产学会 河北省水产技术推广站

河北渔业

影响因子:0.179
ISSN:1004-6755
参考文献量22
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