摘要
为了探究Struthiocalcin-2(SCA-2)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用,试验选择9只产蛋高峰期(30周龄)的健康山麻鸭,采用SMART-RACE方法对山麻鸭SCA-2基因cDNA序列进行克隆,运用生物信息学软件对SCA-2基因编码蛋白质的理化性质、二级和三级结构进行预测及分析,构建SCA-2基因系统进化树;采集试验山麻鸭心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、肌胃、下丘脑、垂体、卵巢,以及输卵管的漏斗部、膨大部、峡部和子宫部共14个组织,每3只做一次混样处理,每个组织共3个重复,提取组织RNA,通过实时荧光定量PCR分析SCA-2基因mRNA在上述组织中的相对表达量.结果表明:SCA-2基因的cDNA全长为726 bp,该基因编码蛋白的分子式为C836H1247 N229O247S8,属于不稳定蛋白,其中丝氨酸(12.6％)、亮氨酸(12.0％)、丙氨酸(10.2％)含量较高;蛋白质的二级结构中,α螺旋占23.35％、β折叠占13.77％、无规卷曲占62.87％,且包含信号肽序列,不含跨膜结构;山麻鸭与绿头鸭、凤头潜鸭和棕硬尾鸭的亲缘关系最近;SCA-2基因在山麻鸭14种组织中均有不同程度的表达,其中在输卵管子宫部和峡部组织中的表达量极显著高于卵巢(P＜0.01),明显高于其他组织.说明本试验成功克隆到了 SCA-2基因,该基因可能在山麻鸭蛋壳的形成过程中扮演着重要角色.
基金项目
福建省自然科学基金(2020J01536)
福建省农业良种育种攻关与产业化工程项目(zycxny2021014)
现代农业产业技术体系建设项目建设专项(CARS-43)
国家自然科学基金(31001005)
NETL
NSTL
万方数据