藏猪与大约克夏猪 GADD45A墓因多态性与表达差异研究

Study on the polymorphism and expression difference of GADD45A gene between Tibetan pigs and Yorkshire pigs

邢璐 ¹段梦琪 ¹罗布白珍 ²徐业芬 ³张健 ¹叶幼荣 ¹商鹏¹

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作者信息

1. 西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000;西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心,西藏林芝860000
2. 林芝市巴宜区畜牧兽医总站,西藏林芝860000
3. 西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000
折叠

摘要

为了探究GADD45A基因在猪肌肉生长中的作用,试验选择180日龄的藏猪和大约克夏猪各8头,采用实时荧光定量PCR法测定和分析两品种试验猪只背最长肌、腿肌和垂体组织中GADD45A基因的mRNA相对表达量;同时选择180日龄藏猪37头和大约克夏猪55头,PCR扩增两品种试验猪只GADD45A基因起始密码子上游3 000 bp左右的序列(5'侧翼区),通过混池测序分析序列的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,同时分析SNPs对GADD45A基因转录的影响.结果表明:在背最长肌和腿肌组织中,藏猪GADD45A基因的mRNA表达量均极显著高于大约克夏猪(P＜0.01);在垂体组织中,藏猪GADD45A基因的mRNA表达量显著高于大约克夏猪(P＜0.05).GADD45A基因5'侧翼区存在G1 952A、C1 689T、G1 614T 3个突变位点,并且这3个突变位点在藏猪和大约克夏猪中均差异极显著(P＜0.01),且均符合哈迪-温伯格定律(P＞0.05);经转录因子预测,在C1 689T位点中,当C碱基突变为T碱基后,出现了新的转录因子——叉头框转录因子D3(forkhead box D3,FOXD3);在G1 614T位点中,当G碱基突变为T碱基后,转录因子——同源框CUT样蛋白1(cut like homeobox 1,CUX1)消失.说明上述突变位点可能是导致180日龄藏猪和大约克夏猪GADD45A基因mRNA相对表达量差异极显著或显著的原因,并推测该位点是调控GADD45A基因表达的关键功能位点.

关键词

藏猪/大约克夏猪/GADD45A基因/肌肉组织/实时荧光定量PCR/单核苷酸多态性

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基金项目

西藏自治区科技重大专项(XZ202101ZD0005N)

四川省区域创新合作项目(2020YFQ0029)

中国农业大学基本科研业务费专项(2021TC002)

出版年

2022

黑龙江畜牧兽医(下半月)

ISSN：

参考文献量5

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