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藏猪与大约克夏猪 GADD45A墓因多态性与表达差异研究

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为了探究GADD45A基因在猪肌肉生长中的作用,试验选择180日龄的藏猪和大约克夏猪各8头,采用实时荧光定量PCR法测定和分析两品种试验猪只背最长肌、腿肌和垂体组织中GADD45A基因的mRNA相对表达量;同时选择180日龄藏猪37头和大约克夏猪55头,PCR扩增两品种试验猪只GADD45A基因起始密码子上游3 000 bp左右的序列(5'侧翼区),通过混池测序分析序列的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,同时分析SNPs对GADD45A基因转录的影响.结果表明:在背最长肌和腿肌组织中,藏猪GADD45A基因的mRNA表达量均极显著高于大约克夏猪(P＜0.01);在垂体组织中,藏猪GADD45A基因的mRNA表达量显著高于大约克夏猪(P＜0.05).GADD45A基因5'侧翼区存在G1 952A、C1 689T、G1 614T 3个突变位点,并且这3个突变位点在藏猪和大约克夏猪中均差异极显著(P＜0.01),且均符合哈迪-温伯格定律(P＞0.05);经转录因子预测,在C1 689T位点中,当C碱基突变为T碱基后,出现了新的转录因子——叉头框转录因子D3(forkhead box D3,FOXD3);在G1 614T位点中,当G碱基突变为T碱基后,转录因子——同源框CUT样蛋白1(cut like homeobox 1,CUX1)消失.说明上述突变位点可能是导致180日龄藏猪和大约克夏猪GADD45A基因mRNA相对表达量差异极显著或显著的原因,并推测该位点是调控GADD45A基因表达的关键功能位点.
Study on the polymorphism and expression difference of GADD45A gene between Tibetan pigs and Yorkshire pigs

邢璐、段梦琪、罗布白珍、徐业芬、张健、叶幼荣、商鹏

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西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000

西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心,西藏林芝860000

林芝市巴宜区畜牧兽医总站,西藏林芝860000

藏猪 大约克夏猪 GADD45A基因 肌肉组织 实时荧光定量PCR 单核苷酸多态性

西藏自治区科技重大专项四川省区域创新合作项目中国农业大学基本科研业务费专项

XZ202101ZD0005N2020YFQ00292021TC002

2022

10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.06.0282

黑龙江畜牧兽医(下半月)

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ISSN：
年,卷(期)：2022.(3)
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