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河北省塞内卡病毒AVP2基因克隆和序列分析

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为了解河北省塞内卡病毒A(SVA)VP2基因的变异及分子进化情况,试验设计了一对VP2基因扩增引物,通过RT-PCR方法扩增和克隆测序,利用MEGA 7.0软件对测序获得的VP2基因序列和GenBank上的参考序列进行遗传进化分析,运用MegAlign 5.0软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析.结果表明:成功扩增并测序得到VP2基因序列,将该序列上传至GenBank,获得基因登录号为MZ031967,命名为SVA HB-BD株.该毒株与中国毒株核苷酸序列相似性为95.9％～99.6％;与原型毒株SVV-001(DQ64125-7核苷酸)相似性较低,为94.6％;与其他美国毒株(MN812946、MN812947、KC667560、MH704432、MN812938、MN812937、KU954086、NC011349)核苷酸相似性为93.0％ ～94.6％.SVA HB-BD株与2015—2016年分离毒株亲缘关系较近,处于同一分支,而与2017—2018年分离毒株亲缘关系较远.SVA HB-BD株与广东省分离毒株氨基酸序列相似性较高,并且在VP2蛋白中和表位位点高度保守.说明HB-BD株与中国毒株具有相同起源,并且在不断演变.
Cloning and sequence analysis of VP2 gene of Senecavirus A in Hebei Province

王晶、郭禹、赵云环、顾文源、刘涛、翟刚、张帅、王丙雷、左玉柱、范京惠

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河北农业大学 动物医学院,河北 保定071001

河北省动物疫病预防控制中心,石家庄050053

瑞普(保定)生物药业有限公司,河北 保定071000

河北省兽医生物技术创新中心,河北 保定071001

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塞内卡病毒A VP2基因 PCR扩增 序列分析 遗传进化

河北省重点研发计划河北省农业产业技术体系建设项目生猪创新团队项目

19226622DHBCT2018110207

2022

10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.03.0279

黑龙江畜牧兽医(下半月)

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ISSN：
年,卷(期)：2022.(4)
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