摘要
为了建立一种快速鉴别PRRSV、基因2型CSFV、PRV和JEV的一步法多重RT-PCR检测方法,试验分别以PRRSV ORF6基因、基因2型CSFV E2基因、PRV gE基因和JEV E基因为靶基因构建重组核酸标准品;设计4对特异性检测引物,在同一反应体系中对One-step RT-PCR Enzyme Mix浓度、引物浓度和退火温度等进行优化,检验特异性、敏感性和重复性;用建立的一步法多重RT-PCR检测方法与商品化试剂盒同时对已知临床样本[35份PRRSV、45份CSFV、20份PRV(gE)和25份JEV阳性核酸和20份阴性核酸样本]进行检测,比较符合率.结果表明:经反应条件的优化确定一步法多重 RT-PCR 检测方法的最佳扩增体系[5×QIANGEN One-step RT-PCR Buffer 10μL,dNTP Mix 2 μL,One-step RT-PCR Enzyme Mix(20 U/μL)2 μL,上下游引物(基因 2 型 CSFV、JEV 引物浓度均为5 μmol/L,PRRSV引物浓度为3 μmol/L,PRV引物浓度为7 μmol/L)各1μL,模板1 μL,DEPC水补足至50μL]和扩增程序[50℃30 min;95℃15 min;94℃30 s,58℃30～45 s(基因2型CSFV、PRRSV 30 s,PRV、JEV 45 s),72℃1 min,共循环 35 次;72℃10 min].该方法对基因 1 型 CSFV 毒株(Shimen株)、CSFV疫苗株(HCLV株)、PRV疫苗株、BVDV及9种猪常见病毒和细菌病原均未检出;对PRRSV、基因2型CSFV、PRV和JEV核酸标准品检测下限分别为1.72×102 copies/μL、1.97x 103 copies/μL、1.94×103 copies/μL和2.08×102 copies/μL;该方法具有良好的重复性;与商品化试剂盒检测结果的符合率分别为PRRSV 100％(k=1)、基因2型CSFV 96.9％(k=0.93)、PRV 100％(k=1)和JEV 100％(k=1).说明本研究建立了一种能同时检测PRRSV、基因2型CSFV、PRV(gE基因)和JEV的快速、精准和高效的一步法多重RT-PCR检测方法,该方法具有良好的特异性、敏感性和重复性.
基金项目
西南民族大学研究生创新型科研项目(2020NQN29)
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