湖南省部分地区养猪场PEDV的检测及S1基因序列变异分析

Detection of Porcine epidemic diarrhea virus in pig farms in part areas of Hunan Province and S1 gene sequence variation analysis

彭娜娜 ¹王文 ¹范方程 ¹宁慧敏 ¹邓瑞德 ¹董伟¹

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作者信息

1. 湖南农业大学动物医学院,长沙410128
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摘要

为了解2020-2021年湖南省部分地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)遗传变异情况,试验从10个暴发仔猪腹泻的猪场采集40份样品进行PEDV核酸检测,统计阳性率,并对部分阳性样品的S1基因进行扩增、测序,并进行序列同源性分析和遗传进化分析.结果表明:场阳性率为60.0％,40份组织样品中有21份为PEDV阳性,阳性率为52.5％;6个阳性猪场随机挑选的6份样品PEDV毒株S1基因扩增得到大小均为1 700 bp左右的目的条带,其核苷酸和对应推导的氨基酸序列相似性分别为97.2％～99.8％和95.4％～99.5％,与国内外流行的PEDV变异株(G2型)对应核苷酸序列相似性分别为96.8％～99.2％和95.0％～98.7％;与PEDV疫苗株(CV777株,G1型)对应核苷酸序列相似性分别为91.2％～92.3％和88.9％～90.8％.进一步遗传进化分析结果发现,获得的6个PEDV毒株均属于G2亚群,与我国流行的PEDV变异株所属分支相隔很近.说明PEDV是导致湖南省部分地区仔猪腹泻的常见病原,且均为PEDV变异株.

关键词

猪流行性腹泻病毒/S1基因/遗传变异/系统进化分析/湖南省

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出版年

2022

黑龙江畜牧兽医(下半月)

ISSN：

参考文献量14

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