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广西地区一株新型鸭呼肠孤病毒的分离鉴定及σC基因遗传进化分析

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为了解广西地区新型鸭呼肠孤病毒(novel Duck reovirus,NDRV)的分子流行病学特征并揭示其遗传变异情况,试验采用RT-PCR方法对某鸭场送检的病料进行病原鉴定,将鉴定为阳性的样品接种于9～10日龄SPF鸡胚尿囊腔进行病毒的分离,对分离到的毒株的σC基因进行扩增、克隆和测序,并与参考毒株σC 基因序列进行比对分析,绘制系统进化树.结果表明:分离到一株NDRV毒株,命名为NDRV-GX株.该分离毒株与NDRV代表毒株高度同源,核苷酸相似性为92.5％～100％,氨基酸相似性为94.2％～100％;而与番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV)及禽呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)分离毒株的核苷酸相似性为26.7％～37.2％,氨基酸相似性为27.8％～38.1％;与MDRV、ARV分离毒株处于进化树的不同分支,而与其他NDRV代表毒株处于同一分支.说明该分离毒株为NDRV,与NDRV代表毒株具有相近的遗传演化关系,同属于基因2型.
Isolation and identification of a novel Duck reovirus in Guangxi region and analysis of its σC gene genetic evolution

何奇松、温新瑞、蓝惠华、石永胜、马琳、熊毅、李媛、刘捷、陈洲、苏文广

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广西壮族自治区动物疫病预防控制中心,南宁530004

北海市动物疫病预防控制中心,广西北海542600

新型鸭呼肠孤病毒 分离 鉴定 σC基因 序列 分析 遗传进化

北海市科技计划广西农业农村厅科技项目

北科合202082027Z201985

2022

10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.11.0067

黑龙江畜牧兽医(下半月)

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ISSN：
年,卷(期)：2022.(10)
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