广西地区一株新型鸭呼肠孤病毒的分离鉴定及σC基因遗传进化分析

Isolation and identification of a novel Duck reovirus in Guangxi region and analysis of its σC gene genetic evolution

何奇松 ¹温新瑞 ²蓝惠华 ¹石永胜 ²马琳 ¹熊毅 ¹李媛 ²刘捷 ¹陈洲 ²苏文广²

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作者信息

1. 广西壮族自治区动物疫病预防控制中心,南宁530004
2. 北海市动物疫病预防控制中心,广西北海542600
折叠

摘要

为了解广西地区新型鸭呼肠孤病毒(novel Duck reovirus,NDRV)的分子流行病学特征并揭示其遗传变异情况,试验采用RT-PCR方法对某鸭场送检的病料进行病原鉴定,将鉴定为阳性的样品接种于9～10日龄SPF鸡胚尿囊腔进行病毒的分离,对分离到的毒株的σC基因进行扩增、克隆和测序,并与参考毒株σC 基因序列进行比对分析,绘制系统进化树.结果表明:分离到一株NDRV毒株,命名为NDRV-GX株.该分离毒株与NDRV代表毒株高度同源,核苷酸相似性为92.5％～100％,氨基酸相似性为94.2％～100％;而与番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV)及禽呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)分离毒株的核苷酸相似性为26.7％～37.2％,氨基酸相似性为27.8％～38.1％;与MDRV、ARV分离毒株处于进化树的不同分支,而与其他NDRV代表毒株处于同一分支.说明该分离毒株为NDRV,与NDRV代表毒株具有相近的遗传演化关系,同属于基因2型.

关键词

新型鸭呼肠孤病毒/分离/鉴定/σC基因/序列/分析/遗传进化

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基金项目

北海市科技计划(北科合202082027)

广西农业农村厅科技项目(Z201985)

出版年

2022

黑龙江畜牧兽医(下半月)

ISSN：

被引量1

参考文献量9

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