首页|转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达

转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达

扫码查看
原文链接
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
单锌指DNA结合蛋白(DNA binding with one finger,Dof)是植物中特有的一类转录因子,在植物生长发育与非生物胁迫响应中发挥非常重要的作用.利用妃子笑荔枝果实发育RNA-seq数据库,采用生物信息学分析方法,对荔枝Dof(LcDof)基因家族的基本理化特性,亚细胞定位,蛋白质保守结构域,进化关系等进行分析,同时对LcDof基因家族在果实发育中的表达情况进行分析.结果 表明:荔枝中包含有19个LcDof基因家族成员,LcDof编码蛋白范围在157～ 497个氨基酸残基(Amino acid, aa),对应的分子量为17.70～54.35 kDa,等电点(pI)范围为4.49～ 9.42;预测LcDof家族成员亚细胞定位均定位于细胞核.系统进化关系分析表明,LcDof基因家族分为4组(Group Ⅰ～Group Ⅳ),LcDof在不同发育阶段的表达模式不同,其中LcDof7、LcDof9、LcDof12、LcDof15在果肉不同发育时期表达量较高,而LcDof3、LcDof10、LcDof16、LcDof17、LcDof19表达量较低.
Transcriptome-wide Identification and Analysis of the Dof Gene Family in Litchi chinensis Sonn.

董晨、魏永赞、王弋、郑雪文、李伟才

展开 >

中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室,广东湛江524091

荔枝 Dof转录因子 基因家族 生物信息分析 表达分析

国家重点研发计划广东省自然科学基金国家荔枝龙眼产业技术体系

2019YFD10009002018A030307012CARS-33-21

2021

热带生物学报
海南大学

热带生物学报

CSTPCD
影响因子：0.406
ISSN：1674-7054
年,卷(期)：2021.12(1)
  • 1
  • 4