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基于宏基因组测序的橡胶林病原微生物的分析

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为了解橡胶[Hevea brasiliensis(H.B.K.)Muell.-Arg.]林土壤和根系(根际和根表)广谱病原微生物的组成及其影响因素,以海南(儋州、万宁和乐东)和西双版纳(景洪、勐仑和勐满)地区健康橡胶林的土壤、根际和根表为材料,采用宏基因组测序技术,分析橡胶林病原微生物的组成及其影响因素.结果表明,植物病原微生物在门的水平为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和子囊菌门(Ascomycota);病原微生物在属水平为假单孢菌属(Pseudomonas)、劳尔氏菌属(Ralstonia)、伯克霍尔德氏菌属(Burkholderia)、链霉菌属(Streptomyces)、农杆菌属(Agrobacterium)、黄单胞菌属(Xanthomonas)、泛菌属(Pantoea)、麦角菌属(Clavibacter)、果胶杆菌属(Pectobacterium)和木质部小菌属(Xylella),在属水平上主要以子囊菌门为主.海南和西双版纳地区的根际病原微生物在属水平上无显著差异.土壤和根际样本病原微生物组成相似,各根表样本病原微生物组成相似,硝态氮与病原微生物呈显著正相关.
Analysis of pathogenic microorganisms in rubber plantations based on macrogenome sequencing

全飞、兰国玉、魏亚情、李明美、孙树晴、杜昊楠

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中国热带农业科学院 橡胶研究所, 海口 571101

海南大学 植物保护学院, 海口 570228

海南大学 生态与环境学院,海口 570228

海南大学 林学院, 海口 570228

海南大学 热带作物学院, 海口 570228

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橡胶林 宏基因组测序 土壤 根系 病原微生物

海南省重点研发项目国家自然科学基金海南省自然科学基金高层次人才项目

ZDYF201914531770661320RC733

2022

热带生物学报
海南大学

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CSTPCD
影响因子：0.406
ISSN：1674-7054
年,卷(期)：2022.13(1)
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