热带生物学报2024,Vol.15Issue(4) :452-459.DOI:10.15886/j.cnki.rdswxb.20230056

pSETsacB质粒构建及其对达卡气单胞菌kdpE基因的有痕与无痕敲除效率评价

Construction of pSETsacB plasmid and evaluation of kdpE gene knockout efficiency with and without markers in Aeromonas dhakensis

凌博 陈丽青 王宇 杨诺 范丽霞 郭桂英 李雪松 曾纪锋 李迁 郑继平
热带生物学报2024,Vol.15Issue(4) :452-459.DOI:10.15886/j.cnki.rdswxb.20230056

pSETsacB质粒构建及其对达卡气单胞菌kdpE基因的有痕与无痕敲除效率评价

Construction of pSETsacB plasmid and evaluation of kdpE gene knockout efficiency with and without markers in Aeromonas dhakensis

凌博 1陈丽青 2王宇 3杨诺 1范丽霞 1郭桂英 4李雪松 1曾纪锋 2李迁 5郑继平1
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作者信息

  • 1. 海南大学生命科学学院,海口 570228
  • 2. 海南大学 动物科技学院,海口 570228
  • 3. 上海市农业科学院 生物技术研究所,上海 201106
  • 4. 海南大学 理学院,海口 570228
  • 5. 海南大学 网络与技术中心,海口 570228
  • 折叠

摘要

为构建一种新型基因敲除质粒,以pSET4s和pK18mobsacB质粒为基础,通过PCR和酶切连接的方法,构建了新质粒pSETsacB,然后以pK18mobsacB质粒为对照,评价新建质粒对达卡气单胞菌kdpE基因的有痕敲除(带有四环素筛选标记)和无痕敲除效率.结果表明,两种质粒在有痕敲除效率上无差别,但在无痕敲除上,pSETsacB的敲除效率显著高于对照质粒pK18mobsacB.由于pSETsacB为穿梭性温敏质粒,因此,该质粒可望在革兰氏阳性和阴性菌的遗传机制研究中皆可发挥作用,本研究同时也为检视kdpE基因在达卡气单胞菌中的功能提供了前期的突变体材料.

Abstract

In order to construct a novel gene-knockout plasmid,a novel plasmid pSETsacB was constructed based on the plasmids pSET4s and pK18mobsacB by using PCR and cloning techniques.Then pK18mobsacB was used as control,the knockout efficiency of kdpE gene in Aeromonas dhakensis was evaluated via the newly constructed plasmid with or without tetr marker.The results showed that there was no difference in the knockout efficiency between the two plasmids with tetr marker,but the efficiency of scarless deletion by pSETsacB was significantly higher than that of the control plasmid pK18mobsacB.pSETsacB is a thermosensitive shuttle plasmid,and is hence expected to play a role in the genetic mechanism of Gram-positive and Gram-negative bacteria.This study also provides important mutant material for investigating the kdpE gene of A.dhakensis.

关键词

pSETsacB/kdpE基因/基因敲除

Key words

pSETsacB/kdpE gene/gene knockout

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基金项目

国家自然科学基金(32060788)

国家自然科学基金(32060131)

海南省自然科学基金(321MS007)

海南省自然科学基金(821MS029)

海南省自然科学基金(821RC1052)

海南省自然科学基金(2019RC084)

出版年

2024
热带生物学报
海南大学

热带生物学报

CSTPCD
影响因子:0.406
ISSN:1674-7054
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