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藜麦WOX转录因子家族的鉴定及表达分析

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为揭示藜麦WOX基因家族的功能,为藜麦耐低氮品种的培育提供参考,利用生物信息学方法,对藜麦WOX基因进行全基因组鉴定,并对其理化性质、系统发育、基因结构、保守结构域、保守基序、组织表达和响应氮胁迫的表达进行分析.研究结果表明:藜麦中共有13个WOX转录因子,蛋白长度159～676 aa,相对分子质量18510～76730,等电点5.27～9.56;每个成员含有1～4个内含子及2～5个外显子,WOX蛋白都具有由34～60个氨基酸组成的Homeobox保守结构域.系统进化树显示,来源于拟南芥、水稻和藜麦的39个WOX基因分为3组,每一组都含有3个物种的家族成员,同一个物种的WOX基因具有更近的遗传距离.组织表达热图显示,藜麦WOX基因组织表达特异性明显,在茎中的表达量最高,其次是种子和叶,在幼苗中的表达量最低.AUR62031363和AUR62035466对氮胁迫的响应最为显著.
Identification and Expression Analysis of WOX Transcription Factor Family of Chenopodium quinoa

朱满喜、杨雅舒、杨小兰、张芳、杨利艳、王创云

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山西师范大学生命科学学院,中国 临汾 041000

山西省农业科学院作物科学研究所,中国 太原 030031

藜麦 WOX转录因子 生物信息学 基因表达 氮胁迫

山西省应用基础研究计划项目院士工作站专项资助项目

201901D11128520190423

2020

湖南师范大学自然科学学报
湖南师范大学

湖南师范大学自然科学学报

CSTPCD北大核心
影响因子：0.62
ISSN：1000-2537
年,卷(期)：2020.43(4)
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