花生学报2021，Vol.50Issue(2) ：1-7,20.DOI:10.14001/j.issn.1002-4093.2021.02.001

基于高通量测序分析花生不同器官内生细菌群落多样性

Diversity Analysis on Endophytic Bacterial Community in Different Organs of Arachis hypogaea Linn. Based on High-throughput Sequencing

李亮亮 雷高 李磊 杜志敏 甄静 王继雯 刘德海 杨文玲
花生学报2021，Vol.50Issue(2) ：1-7,20.DOI:10.14001/j.issn.1002-4093.2021.02.001
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基于高通量测序分析花生不同器官内生细菌群落多样性

Diversity Analysis on Endophytic Bacterial Community in Different Organs of Arachis hypogaea Linn. Based on High-throughput Sequencing

李亮亮 1雷高 1李磊 1杜志敏 1甄静 1王继雯 1刘德海 1杨文玲1
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作者信息

  • 1. 河南省科学院生物研究所有限责任公司/河南省微生物工程重点实验室,河南郑州 450008
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摘要

通过Illumina MiSeq高通量测序技术,对花生根、茎、叶、花不同器官内生细菌16S rRNA的V5～V7可变区进行测序,研究花生内生细菌群落多样性.从花生不同器官内一共获得61396条有效序列和468个OTU(Operational Taxonomic Units).物种分类显示花生内生细菌种类隶属于21个门、43个纲、107个目、177个科和284个属.根部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)、慢生根瘤菌属(Bra-dyrhizobium)和魏斯氏菌属(Weissella),相对丰度分别为37.67％、25.13％和7.38％;茎部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)和红球菌属(Rhodococcus),相对丰度分别为73.12％和8.88％;叶部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)和红球菌属(Rhodococcus),相对丰度分别为78.65％和8.55％;花部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas),相对丰度为15.15％.PICRUSt功能预测表明,叶部内生细菌中参与调控各种代谢通路的物种丰度最高,茎部和根部次之,花部最低.以上研究结果表明花生内生细菌具有丰富的种群多样性,为今后开发利用花生内生细菌资源奠定了基础.

关键词

花生/高通量测序/种群多样性/内生细菌/物种丰度

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基金项目

河南省科学院基本科研业务费项目(210605008)

国家自然科学基金(31800361)

河南省科学院杰青人才培养项目(200405006)

河南省科学院助推科技成果转化项目(210205029)

出版年

2021
花生学报
山东省花生研究所

花生学报

CSTPCD北大核心
影响因子：0.577
ISSN：1002-4093
被引量5
参考文献量8
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