液相芯片技术在花生品种纯度鉴定中的应用

Application of Liquid Chip Technology on Varietal Purity Identification in Peanut

郝明国 ¹张君 ¹陈光辉 ²杨松楠 ¹陈亮宇 ¹袁美 ²梁嘉宁 ¹韩笑¹

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作者信息

1. 吉林农业大学农学院,吉林长春 130118
2. 山东省花生研究所,山东青岛 266100
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摘要

本研究采用花生10K液相芯片结合Illumina测序平台进行高通量测序,检测100份花生样本,获得目标区域内总计1万个SNP.与表型鉴定结果完全一致.使用R、PLINK、MEGA-X等软件处理SNP数据,主成分分析、降维分析和聚类分析结果均表明,花生品种"东北王"的纯度为98.9％,本研究结果表明液相芯片技术在品种纯度鉴定上具有信息量大、灵敏度高和准确性极高等特点,为育种者鉴定花生品种纯度提供了新的选择.

关键词

花生/品种纯度/液相芯片技术/高通量测序/单核苷酸多态性

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基金项目

吉林省教育厅科学研究项目(JJKH20210214KJ)

山东省重点研发计划(2018GNC110036)

出版年

2021

花生学报

山东省花生研究所

花生学报

CSTPCD北大核心

影响因子：0.577

ISSN：1002-4093

参考文献量18

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