湖北工业大学学报2022,Vol.37Issue(1) :71-76.

数据挖掘鉴定PRIM1与肝细胞癌不良预后相关

Data Mining Identifies PRIM1 Associated with Poor Prognosis of Hepatocellular Carcinoma

丁庆林 魏艳红 胡康洪
湖北工业大学学报2022,Vol.37Issue(1) :71-76.

数据挖掘鉴定PRIM1与肝细胞癌不良预后相关

Data Mining Identifies PRIM1 Associated with Poor Prognosis of Hepatocellular Carcinoma

丁庆林 1魏艳红 1胡康洪1
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作者信息

  • 1. 湖北工业大学中德生物医学中心,湖北武汉430068
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摘要

对DNA引物酶亚基1(DNA primase polypeptide 1,PRIM1)与肝细胞癌(Liver Hepatocellular Carcino-ma,LIHC)不良预后的相关性进行生物信息学研究.作为关键的酶促成分,PRIM1对DNA的合成至关重要.在TIMER数据库中发现,PRIM1在多种癌症中失调,且在LIHC中显著上调,提示其可能参与人类癌症发生发展进程.基因表达综合数据库的LIHC相关数据集以及细胞系和组织证实了PRIM1高表达.经对UALCAN数据库亚组分析,不同种族和亚型的LIHC患者中PRIM1的表达均上调,可辅助判断患者临床病例特征.从cBioPortal数据库中发现PRIM1出现基因组改变,包括拷贝数扩增和意义不明的错义突变和截断突变可能与LIHC发展有关.对PRIM1共表达基因进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析,结果揭示了其涉及的生物学过程和功能.通过Kaplan-Meier Plotter数据库分析PRIM1的预后价值表明,高PRIM1表达与LIHC不良预后显著相关.数据挖掘揭示了PRIM1在LIHC中表达和突变的数据,且与LIHC不良预后相关.

关键词

DNA引物酶亚基1/肝细胞癌/疾病预后

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基金项目

大学生创新创业训练计划(337203)

出版年

2022
湖北工业大学学报
湖北工业大学

湖北工业大学学报

CHSSCD
影响因子:0.258
ISSN:1003-4684
参考文献量33
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