目的 分析2009年龙岩市流行的人肠道病毒71(EV 71)分离株的分子生物学特征.方法 从手足口病例的153份咽拭标本中分离EV 71病毒株,选取其中3株,用RT-PCR扩增VPl基因片段,并进行测序和病毒种系进化等分析.结果 3株EV 71均为C4基因亚型,与其他省份C4亚型分离株的同源性为94.8%-99.0%;其中EV 71/FJ-LY241/09和EV 71/FJLY299/09具有更高的同源性,而另1株EV 71/FJLY231/09与其他2株距离稍远.氨基酸序列分析表明,3株病毒的VP1具有3个氨基酸位点差异.结论 2009年龙岩市流行的EV 71为C4基因亚型,与目前国内其他省份流行的毒株无显著差别,但不同分离株有一定差异,其原因需进一步监测和研究.