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长牡蛎(Crassostrea gigas)17个EST-SNP标记的开发

DEVELOPMENT OF 17 SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS (SNPs) IN CRASSOSTREA GIGAS SEARCHED FROM EST DATABASE

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利用长牡蛎已有的EST序列数据库,筛选得到候选SNP位点共计1140个.根据候选SNP位点共设计引物82组,通过片段长度差异等位基因特异性PCR(fragment length discrepant allele specific PCR,FLDAS-PCR)的分型方法,在一野生群体中进行检测和验证,结果共有17个SNP候选位点显示多态性.研究结果表明,通过基于EST数据库的SNP开发,可以有效弥补某些海洋生物因基因组学滞后影响SNP标记开发的现状.

王绍宗、李莉、亓海刚、张国范

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中国科学院研究生院,北京,100049

中国科学院海洋研究所,青岛,266071

长牡蛎 单核苷酸多态性 表达序列标签 片段长度差异等位基因特异性PCR

国家重点基础研究发展规划(973计划)国家自然科学基金国家公益性行业(农业)科研专项中国科学院知识创新工程领域前沿项目

2010CB12640240730845nyhyzx07-0472008--2010

2010

海洋与湖沼
中国海洋湖沼学会 中国科学院海洋研究所

海洋与湖沼

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.737
ISSN：0029-814X
年,卷(期)：2010.41(2)
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