华中师范大学学报(自然科学版)2024,Vol.58Issue(5) :542-550.DOI:10.19603/j.cnki.1000-1190.2024.05.006

阿尔茨海默病患外周血和海马区中铜/铁蛋白及核心基因的生物信息学分析

Bioinformaticsanalysis of copper/iron proteins and core genes in peripheral blood and hippocampal region of Alzheimer's disease patients

张慧琼 张倩 陈红安 江南
华中师范大学学报(自然科学版)2024,Vol.58Issue(5) :542-550.DOI:10.19603/j.cnki.1000-1190.2024.05.006

阿尔茨海默病患外周血和海马区中铜/铁蛋白及核心基因的生物信息学分析

Bioinformaticsanalysis of copper/iron proteins and core genes in peripheral blood and hippocampal region of Alzheimer's disease patients

张慧琼 1张倩 1陈红安 1江南1
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作者信息

  • 1. 武汉工程大学环境生态与生物工程学院,武汉 430205
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摘要

阿尔茨海默病(AD)与铜(Cu)、铁(Fe)代谢紊乱密切关联.该文完成了 AD病患外周血、海马区中的微阵列测序数据与人源Cu、Fe蛋白组的比较与生物信息学分析.结果显示外周血中NDUFS2基因及对应蛋白变化显著,可作AD检测靶标;海马区中88种Cu、Fe蛋白与代谢、去甲基化、电子传递等功能直接关联,3种核心基因(CYCS、CYP3A5、CYP2D6)及对应的Fe蛋白能通过引发细胞色素相关代谢紊乱影响AD发展.这为理解和检测AD提供了新思路,揭示了 Cu、Fe蛋白变化对AD的影响.

Abstract

Alzheimer's Disease(AD)is closely related to the dysregulation of copper(Cu),and iron(Fe)metabolism.This study conducted a comparative and bioinformatics analysis of transcriptome data from peripheral blood and hippocampal area of AD patients with human Cu and Fe protein groups.Results suggested that the NDUFS2 gene and its corresponding protein in peripheral blood showed significant change and could be used as targets for AD detection.88 types of Cu and Fe proteins in the hippocampal area are directly correlated with metabolic functions,demethylation,and electron transfer.Furthermore,three core genes(CYCS,CYP3A5,and CYP2D6)and their corresponding Fe proteins could impact the progression of AD by causing cytochrome-related metabolic disorders.This provides a new perspective for understanding and diagnosing AD,revealing the influences of Cu,Fe protein alterations on the course of AD.

关键词

阿尔茨海默病/金属蛋白/差异表达基因/生物信息学

Key words

Alzheimer's disease/metalloproteins/differential expression genes/bioinformatics

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基金项目

国家自然科学青年基金项目(22207091)

武汉市知识创新专项曙光计划项目(2022020801020358)

武汉工程大学研究生教育创新基金(CX2023163)

出版年

2024
华中师范大学学报(自然科学版)
华中师范大学

华中师范大学学报(自然科学版)

CSTPCD北大核心
影响因子:0.512
ISSN:1000-1190
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