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谷子MYB-CC基因家族的鉴定与表达分析

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MYB-CC基因家族是由MYB-DNA结合域和CC(coiled-coil)结构域组成的,其中CC结构域能通过折叠参与蛋白质之间的相互作用,是一个二聚体结构域.这类MYB-CC转录因子是植物特有的,除磷饥饿响应蛋白1(PHR1)外,拟南芥中另外14个蛋白也同样具有这两个结构域.部分MYB-CC基因已经被证明可调控植物中磷酸盐吸收和控制磷饥饿反应.为了探索谷子MYB-CC基因家族的特征和功能,本文通过生物信息学分析来解析谷子MYB-CC基因家族的特征,分析其表达模式及谷子与水稻、玉米基因组中的MYB-CC基因家族的共线性、选择压力.结果表明:通过基因在谷子染色体上的定位情况,共筛选到谷子MYB-CC基因家族基因18个,分布在7条染色体上;基序分析发现存在1个相对保守的基序motif 1;顺式作用元件分析发现,参与防御和胁迫响应相关的MYB-CC基因有6个;基因表达模式分析结果显示,SiMYB-CC6在根和茎秆中特异性表达.该研究结果可为谷子MYB-CC基因家族的进一步研究提供一定的参考依据.
Identification and Expression Analysis of MYB-CC Gene Family in Foxtail Millet

李明明、晋敏姗、胡海斌、王浩、于港华、邢国芳

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山西农业大学农学院,太谷 030801

谷子 MYB-CC基因家族 生物信息学 基因表达 低磷胁迫

山西省重点研发计划项目山西省留学基金择优资助项目晋中市重点研发计划项目国家自然科学基金

201803D221008-42019045Y19201131901598

2021

10.3969/j.issn.1007-7146.2021.03.008

激光生物学报
中国遗传学会

激光生物学报

CSTPCD
影响因子：0.378
ISSN：1007-7146
年,卷(期)：2021.30(3)
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