摘要
目的 基于生物信息学分析新型冠状病毒E蛋白的结构特征,并筛选出潜在的B细胞、T细胞抗原表位.方法 通过多种生物信息软件分析SARS-CoV-2 E蛋白的一级结构、跨膜区域、二级结构,B细胞表位、T细胞相关表位并计算其人口覆盖率.结果 SARS-CoV-2 E蛋白含有75个氨基酸残基,脂溶性高,是疏水性蛋白,存在一个跨膜结构区域12-34aa,二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主.筛选出一个可能的B细胞抗原表位,并发现与 MHCⅠ类和MHC Ⅱ类结合的10种肽是疫苗设计的有希望的候选者,这些候选表位可分别覆盖世界88.5％和99.99％的人群.结论 通过生物信息学分析了新型冠状病毒E蛋白的结构特征;筛选出潜在的B细胞、T细胞抗原表位,其中多个T细胞表位人群覆盖率较高,有希望成为疫苗候选表位.
基金项目
江西省卫生健康委科技计划项目(SKJP_220201512)
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