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高良姜CCR基因的序列特征和表达模式分析
高良姜CCR基因的序列特征和表达模式分析
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中文摘要:
肉桂酰辅酶A还原酶(cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是植物苯丙氨酸代谢途径的关键酶,参与调控木质素等次生代谢产物的生物合成.从前期建立的高良姜转录组测序数据中鉴定出高良姜CCR基因的cDNA序列,采用生物信息学方法对其编码蛋白的理化性质、保守功能域、亲/疏水性、跨膜结构域、信号肽、空间结构及系统发育关系等进行分析,并利用实时荧光定量PCR技术检测CCR基因在高良姜不同器官中的相对表达量.结果显示,高良姜CCR基因编码区长度为 1 008bp,编码 335 个氨基酸.该基因的编码蛋白分子量为 36.68 kDa,含有一处转运肽,不含信号肽、靶向肽和跨膜结构,具有CCR保守功能域.CCR基因在高良姜叶、茎和根茎中均有表达,其中以在茎中的表达最为显著,其次是根茎,最少是叶片.本研究明确了高良姜CCR酶基因的序列特征和表达模式,为基于CCR基因工程的高良姜木质素生物合成及种质改良奠定了一定基础.
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作者:
黄琼林
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作者单位:
广东医科大学,广东湛江 524023
关键词:
高良姜
肉桂酰辅酶A还原酶
木质素
生物信息学
表达模式
基金:
广东省中医药局中医药科研项目
项目编号:
20211224
出版年:
2024
现代园艺
江西省经济作物局 江西省双金柑桔试验站
现代园艺
影响因子:
0.609
ISSN:
1006-4958
年,卷(期):
2024.
47
(3)
参考文献量
11