现代园艺2024,Vol.47Issue(11) :5-7.

河八王叶绿体基因组的结构特征与系统进化分析

苗小荣 李娟云 黎东海 韩聪颖 牛俊奇
现代园艺2024,Vol.47Issue(11) :5-7.

河八王叶绿体基因组的结构特征与系统进化分析

苗小荣 1李娟云 1黎东海 1韩聪颖 2牛俊奇1
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作者信息

  • 1. 玉林师范学院生物与制药学院,广西玉林 537000
  • 2. 玉林师范学院创新创业学院,广西玉林 537000
  • 折叠

摘要

河八王具有分蘖力强、抗倒伏、抗病能力强等优良性状,是甘蔗杂交育种的优良亲本.为了分析河八王在禾本科中的系统进化地位,采用第二代高通量测定技术对河八王的叶绿体基因组进行测序、组装和注释,分析其结构特征和系统进化关系.结果显示,河八王叶绿体基因组全长141218 bp,NCBI注册号为ON807673;具有2个反向重复序列IRA和IRB(22794 bp)、长单拷贝区(LSC,83095 bp)和短单拷贝区(SSC,12535 bp);具有103个蛋白质编码基因、8个rRNA和38个tRNA;具有114个SSR位点,三核苷酸重复类型最多,五核苷酸重复最少;系统进化表明,河八王与甘蔗属的甘蔗和甜根子草的亲缘关系最近.本研究结果为河八王种质鉴定和谱系地理分析提供了理论依据.

关键词

河八王/叶绿体基因/SSR/系统进化

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基金项目

广西自然科学基金(2021GXNSFAA196061)

广西壮族自治区大学生创新训练项目(S202310606154)

广西壮族自治区大学生创新训练项目(202310606042)

出版年

2024
现代园艺
江西省经济作物局 江西省双金柑桔试验站

现代园艺

影响因子:0.609
ISSN:1006-4958
参考文献量11
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