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基于信息熵的肿瘤样本纯度估算研究

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DNA甲基化几乎与所有类型的癌细胞和基因组区域异常有关,识别与肿瘤相关的差异甲基化位点可作为肿瘤纯度的估算指标,进而评估样本的肿瘤纯度.传统的信息差异位点的选择多关注肿瘤间的异质性,忽略了肿瘤生长空间的异质性,导致评估的肿瘤纯度忽视了样本的特异性.因此,论文基于DNA甲基化数据及样本位点的信息熵,通过选择具有样本特异性的信息差异甲基化位点来估算肿瘤样本的纯度.实验结果表明:论文方法估算出的肿瘤纯度结果与其他方法具有高度一致性.
Research on Purity Estimation of Tumor Samples Based on Information Entropy

王丽华

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中国石油大学(华东)计算机科学与技术学院 青岛 266580

DNA甲基化 肿瘤纯度 样本特异性 信息熵

2021

10.3969/j.issn.1672-9722.2021.10.023

计算机与数字工程
中国船舶重工集团公司第七0九研究所

计算机与数字工程

CSTPCD
影响因子：0.355
ISSN：1672-9722
年,卷(期)：2021.49(10)
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