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基于全基因组关联研究的tag SNP预测方法的研究与分析

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SNP是指基因序列中碱基对的变异,通过对人体SNP位点进行基因分型,可以有效帮助人们找出与遗传疾病相关的基因.然而,对所有SNPs位点进行基因分型的成本过于昂贵.研究表明,部分最具有代表性的SNPs(标签SNP,tag SNP)就可以区分基因变异,选择高质量的tag SNP成为基因研究中的热点内容.论文提出一种基于连锁不平衡度的Genet-ic-majority dominance(GMD)tag SNP预测方法评估tag SNP质量,该方法通过对遗传算法每一次迭代选择的tag SNP集按照多数占优的原则进行预测,定量分析tag SNP集质量.结果表明,论文所提出的方法可以有效评估tag SNP集的质量.
Research and Analysis of Tag SNP Prediction Method Based on Genome-wide Association Study

刘高伟

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中国石油大学(华东)计算机与通信工程学院 青岛 266580

SNP tag SNP 遗传算法 连锁不平衡

2022

计算机与数字工程
中国船舶重工集团公司第七0九研究所

计算机与数字工程

CSTPCD
影响因子:0.355
ISSN:1672-9722
年,卷(期):2022.50(1)
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