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基于全基因组关联研究的tag SNP预测方法的研究与分析
基于全基因组关联研究的tag SNP预测方法的研究与分析
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中文摘要:
SNP是指基因序列中碱基对的变异,通过对人体SNP位点进行基因分型,可以有效帮助人们找出与遗传疾病相关的基因.然而,对所有SNPs位点进行基因分型的成本过于昂贵.研究表明,部分最具有代表性的SNPs(标签SNP,tag SNP)就可以区分基因变异,选择高质量的tag SNP成为基因研究中的热点内容.论文提出一种基于连锁不平衡度的Genet-ic-majority dominance(GMD)tag SNP预测方法评估tag SNP质量,该方法通过对遗传算法每一次迭代选择的tag SNP集按照多数占优的原则进行预测,定量分析tag SNP集质量.结果表明,论文所提出的方法可以有效评估tag SNP集的质量.
外文标题:
Research and Analysis of Tag SNP Prediction Method Based on Genome-wide Association Study
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作者:
刘高伟
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作者单位:
中国石油大学(华东)计算机与通信工程学院 青岛 266580
关键词:
SNP
tag
SNP
遗传算法
连锁不平衡
出版年:
2022
DOI:
10.3969/j.issn.1672-9722.2022.01.007
计算机与数字工程
中国船舶重工集团公司第七0九研究所
计算机与数字工程
CSTPCD
影响因子:
0.355
ISSN:
1672-9722
年,卷(期):
2022.
50
(1)
参考文献量
24