计算机应用研究2021,Vol.38Issue(8) :2365-2369.DOI:10.19734/j.issn.1001-3695.2020.11.0371

基于网格区域化DBSCAN聚类的数字PCR液滴分类方法

Classification method of digital PCR droplets based on grid regional DBSCAN clustering

荣章权 廖丽敏 张端金
计算机应用研究2021,Vol.38Issue(8) :2365-2369.DOI:10.19734/j.issn.1001-3695.2020.11.0371

基于网格区域化DBSCAN聚类的数字PCR液滴分类方法

Classification method of digital PCR droplets based on grid regional DBSCAN clustering

荣章权 1廖丽敏 2张端金1
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作者信息

  • 1. 郑州大学 信息工程学院,郑州450001
  • 2. 广东顺德创新设计研究院,广东 佛山528311
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摘要

针对数字PCR系统的配套软件缺少多重实验液滴分类功能的不足,提出了一种网格区域化DBSCAN聚类算法.首先对数据进行网格映射,建立网格索引;然后计算网格间权值并进行深度搜索扩张;最后将网格空间的聚类结果映射回数据空间.人工数据集的仿真实验表明,所提算法能够有效识别簇边缘区域且具有优良的运行效率.在此基础上,提出了基于网格区域化DBSCAN聚类的数字PCR液滴分类方法,经由对比实验及有效性测试,结果表明所提方法能够便捷、准确地进行液滴分类.可见所提方法适用于数字PCR液滴分类.

关键词

聚类分析/网格划分/DBSCAN聚类/数字PCR

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基金项目

出版年

2021
计算机应用研究
四川省电子计算机应用研究中心

计算机应用研究

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.93
ISSN:1001-3695
参考文献量5
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