摘要
从11个桃品种嫩叶中分别提取基因组DNA,根据GDR数据库中NAC基因序列信息,设计特异引物,PCR扩增,对产物克隆测序.然后,使用DNAman软件进行核苷酸和氨基酸序列比对,使用ORF Finder获得开放阅读框和推导氨基酸序列,使用CDD工具进行蛋白质结构域分析,利用Blastp工具搜索同源蛋白,采用Mega软件绘制系统进化树.结果发现,NAC蛋白第16~140位存在1个NAC结构域,N端比较保守,C端则多样性比较高;核苷酸变异有SNP和Indel 2类,津柳早红和小白桃在第3外显子区SNP和Indel变异数量非常多,说明这2个品种的NAC基因结构具有独特性.蛋白比对发现,桃NAC与梅同源性最高,其次是鸭梨;进化树体现了物种的亲缘关系.结果表明,参试品种NAC基因存在比较丰富的遗传多样性,在保守区内的氨基酸变异可能影响蛋白的功能.
基金项目
天津市应用基础与前沿技术研究计划一般项目(14JCYBJC30100)
天津市科技型中小企业技术创新资金(14ZXCXNC00063)
天津市高等学校科技发展基金(20130617)
国家大学生创新创业训练计划(201410061007)
天津市2014年度"131"创新型人才培养工程()
天津市高校第二批"优秀青年教师资助计划"()
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