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基于16S和COⅠ基因探讨岩扇贝在扇贝科中的分类地位

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采用PCR扩增和序列测定等技术,对岩扇贝(Crassadoma gigantea)线粒体DNA 16S rRNA和COⅠ基因片段进行初步研究,得到16S rRNA基因片段的大小在613.0~634.0bp之间,A、T(U)、G、C的平均含量分别为26.5%、29.7%、24.5%、19.3%;COⅠ基因片段的大小为660bp,碱基A、T、G、C的平均含量分别为17.2%、40.3%、27.2%、15.3%.16S基因在岩扇贝中偏好使用GUU、UUG、AUU、ACG、UAU、CAA、GAG、UUU、UCU、GAU、GGU、GAG、AGG和GGA等25个密码子.COⅠ系统进化树表明,与岩扇贝亲缘关系最近的是柿孔扇贝(Azumapecen farreri),其次是冰岛扇贝(Chlamys islandica).16S系统进化树亲缘关系由近到远依次是北美扇贝(Patinopecten caurinus)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)、Chlamys islandica.

曹善茂、朱丽洁、聂鸿涛、印明昊、刘钢、邹建威、王尧

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大连海洋大学/辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,辽宁大连116023

大连海洋大学水产与生命学院/辽宁省贝类良种繁育工程技术研究中心,辽宁大连116023

辽宁省大连市海洋与渔业局,辽宁大连116023

岩扇贝 COⅠ基因 16S rRNA 密码子偏好性 系统进化树分析

辽宁省海洋与渔业厅项目辽宁省大连市海洋与渔业局项目

2012142012011

2019

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
年,卷(期):2019.47(7)
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