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长江口中华绒螯蟹雌蟹洄游期的肠道菌群多样性

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采集长江口生殖洄游期中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)雌蟹样品,利用16S V4区高通量测序技术研究其抱卵前后肠道菌群的多样性特征,探讨肠道菌群结构组成及与其食性特征的相关性.结果表明,雌蟹抱卵前和抱卵后的肠道样品中共检测出313个和376个OUT,特有OUT分别为112个和175个,占比分别为35.78％和46.54％.就门水平而言,柔膜菌门(Tenericutes)、变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)是其肠道的主要菌群;雌蟹抱卵前和抱卵后的肠道菌群具有显著性差异,变形菌门和厚壁菌门的丰度抱卵后小于抱卵前,而柔膜菌门丰度抱卵后大于抱卵前.就属水平而言,Candidatus_Bacilloplasma和Candidatus_Hepatoplasma是其肠道的主要菌群属,抱卵前占比分别为26.54％和25.81％;抱卵后占比分别为30.29％和29.05％,2个属的丰度在抱卵前后无显著差异.与抱卵前相比较而言,抱卵后雌蟹肠道菌群Chao指数和ACE指数升高,丰度增加,而辛普森指数和香农指数保持稳定,抱卵前后雌蟹肠道菌群的多样性无显著性变化.本研究揭示由于长江口中华绒螯蟹雌蟹的摄食习性和饵料组成在抱卵前后产生了变化,会对其肠道微生物多样性产生一定的影响.

徐静静、冯广朋、陈建华、孙雪娜、黄晓荣

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中国水产科学研究院东海水产研究所/上海长江口渔业资源增殖和生态修复工程技术研究中心,上海200090

上海海洋大学水产与生命学院,上海200090

江苏海洋大学海洋生命与水产学院,江苏连云港222005

中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis) 高通量测序 肠道菌群 多样性

国家重点研发计划重点专项上海市中华绒螯蟹现代农业产业技术体系项目2019年农业农村部财政资金物种品种资源保护专项

2019YFD0901205沪农科产字2017-4号

2021

10.15889/j.issn.1002-1302.2021.01.026

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2021.49(1)
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