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小麦Hsp70基因家族鉴定及蛋白互作网络分析

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为研究小麦Hsp70蛋白的相互作用,利用生物信息学方法,在全基因组范围内对小麦Hsp70基因家族进行鉴定,并进行蛋白互作及可视化分析.结果表明,在全基因组范围内共鉴定到21个结构域高度保守的Hsp70基因家族成员,亚细胞定位显示主要分布于细胞质,蛋白的二级结构中,α-螺旋与无规卷曲类型在每个蛋白中所占比重较大,二者之和大于70％,延伸链和β-转角所占比重较小,二者之和小于30％.互作分析结果表明,TaHsp70-14、TaHsp70-6、TaHsp70-12、TaHsp70-16、TaHsp70-3,TaHsp70-8、TaHsp70-21、TaHsp70-20,TaHsp70-17和TaHsp70-11之间有相互作用,GO分析显示所鉴定基因主要在分子功能、生物过程及细胞成分方面起作用.

楚宗丽、李亮杰、姬虹、程琴、孙君艳

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信阳农林学院,河南信阳464006

小麦 Hsp70 热激蛋白 基因鉴定 蛋白互作

信阳农林学院高水平科研孵化器建设项目河南省科技攻关计划信阳农林学院校青年基金

FCL20200721210211004920200104

2022

10.15889/j.issn.1002-1302.2022.10.006

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2022.50(10)
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