江苏农业科学2023,Vol.51Issue(8) :150-156.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2023.08.022

姜曲海猪ATP2B1基因克隆、生物信息学及组织表达分析

徐盼 赵为民 倪黎纲 张君胜 闫伟 刘家兴 陶勇
江苏农业科学2023,Vol.51Issue(8) :150-156.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2023.08.022

姜曲海猪ATP2B1基因克隆、生物信息学及组织表达分析

徐盼 1赵为民 2倪黎纲 1张君胜 1闫伟 1刘家兴 1陶勇1
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作者信息

  • 1. 江苏农牧科技职业学院动物科技学院,江苏泰州225300
  • 2. 江苏农业科学院畜牧研究所,江苏南京210014
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摘要

克隆姜曲海猪质膜钙转运ATP酶1(ATPase Plasma Membrane Ca2+Transporting1,ATP2B1)基因CDS区序列,对其进行生物信息学分析,并探究ATP2B1基因在不同日龄姜曲海猪子宫组织的表达水平,以期为研究ATP2B1基因在姜曲海猪繁殖性能方面的作用提供参考依据,采用RT-PCR技术扩增姜曲海猪子宫ATP2B1基因CDS区序列,利用生物信息学软件对其进行分析,利用实时荧光定量PCR检测ATP2B1基因在1月龄和8月龄姜曲海猪子宫组织中的表达量.结果显示,姜曲海猪ATP2B1基因CDS区全长3 663 bp,编码1 220个氨基酸,与野猪同源性最高、亲缘关系最近.姜曲海猪ATP2B1蛋白分子质量约为134 737.94 u,原子总数为19 102个,理论等电点(pI)为5.63,带正电荷、负电荷的氨基酸数分别为141、161个.该蛋白最可能位于细胞膜上,为跨膜、非分泌型疏水蛋白质,有159个磷酸化位点和5个N-糖基化位点,无规则卷曲在预测的二级结构中占比最大.实时荧光定量PCR结果显示,ATP2B1基因在8月龄姜曲海猪子宫组织中的表达量显著低于1月龄姜曲海猪子宫组织(P<0.05).本试验为探明ATP2B1基因对猪繁殖性状的影响提供了分子理论依据.

关键词

姜曲海猪/ATP2B1基因/克隆/生物信息学/组织表达

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基金项目

国家自然科学基金(31702089)

江苏省高等学校"青蓝工程"项目()

江苏农牧科技职业学院大学生创新创业训练计划(202112806093Y)

江苏农牧科技职业学院科技创新团队项目(NSF2021TC04)

出版年

2023
江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
参考文献量1
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