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石榴TCP基因家族的生物信息学与表达分析

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TCP是植物特有转录因子家族之一，参与植物的叶发育、花发育、分枝发育、芽的休眠、果实的成熟及花色苷的生物合成等生长发育过程。本研究以石榴基因组数据和转录组数据为材料，分析了石榴TCP基因家族成员的理化性质、系统进化关系、保守结构域、基因结构和表达情况。结果表明，石榴基因组有22个TCP基因，TCP蛋白氨基酸长度在221～644 aa之间，蛋白分子量为23。23～70。76 ku。石榴 TCP基因可分为Class Ⅰ(PCF)和Class Ⅱ(CYC/TB1和CIN)两大类。大多数PgTCP基因无内含子。CIN亚族成员PgTCP1、PgTCP3、PgTCP4、PgTCP5含有miR319调控位点。PgTCP1和PgTCP3在叶片中表达量高，PgTCP1和PgTCP14在花中表达量高。PgTCP22在果皮发育中表达量降低，PgTCP2和PgTCP5在外种皮发育中表达量降低。该研究结果可为石榴TCP家族基因功能研究，探索TCP调控石榴果实发育及品质形成提供参考，为石榴的分子育种提供科学依据。

李晓静、李圣龙、岳亮亮

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红河学院生物科学与农学学院/云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点实验室,云南蒙自 661100

西南林业大学高原湿地中心,云南昆明 650224

石榴 TCP转录因子 基因家族分析 基因表达 生物信息学

国家自然科学地区基金云南省教育厅科学研究基金

421610152023J1115

2024

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.01.006

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2024.52(1)
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