首页|丹参SmWRKY33基因的克隆与表达分析

丹参SmWRKY33基因的克隆与表达分析

扫码查看
原文链接
  • 万方数据
  • 维普
为了研究WRKY33基因在丹参非生物胁迫中的作用机制，以白花丹参为试验材料，对丹参转录组数据进行分析，挖掘出丹参WRKY33基因参考序列并设计特异性引物，利用基因克隆技术从丹参中克隆出WRKY33基因的全长cDNA，命名为SmWRKY33。对SmWRKY33基因进行生物信息学分析，同时利用荧光定量方法探究SmWRKY33基因在逆境胁迫下的表达模式。结果表明，SmWRKY33基因核苷酸长度为1 635 bp，编码544个氨基酸。生物信息学分析显示，SmWRKY33基因的理论相对分子量为60 835。66，等电点为7。00，定位于细胞核，不存在跨膜区及信号肽，SmWRKY33蛋白为不稳定亲水蛋白。亲缘关系显示，SmWRKY33与紫苏、芝麻、白花泡桐的WRKY33亲缘关系较近。密码子偏好性分析得出拟南芥真核表达最适应丹参SmWRKY33基因的外源表达。qRT-PCR结果表明，SmWRKY33基因在低温、高温、PEG、NaCl等逆境胁迫诱导下具有不同的表达模式，其中低温、NaCl能显著诱导SmWRKY33基因的高表达，说明该基因对温度调节、盐胁迫较为敏感，猜测其参与温度、盐胁迫调控反应机制。本试验首次从丹参中克隆出SmWRKY33基因，探讨了该基因在丹参逆境胁迫下的作用机制，旨在为培育丹参的抗逆新品种提供参考基因。

龚婷、刘灵娣、温春秀、武玉翠、王升、万修福、孙亚倩、姜涛

展开 >

河北省农林科学院经济作物研究所,河北石家庄 050051

河北工程大学园林与生态工程学院,河北邯郸 056038

道地药材国家重点实验室,北京 100700

丹参 SmWRKY33基因 生物信息学 qRT-PCR 基因克隆

中央本级重大增减支项目现代农业产业技术体系建设专项河北省重点研发计划专项

2060302CARS-2122326301D

2024

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.03.008

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2024.52(3)
  • 23