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基于线粒体Cytb基因的江淮下游6个湖泊翘嘴鲌群体遗传多样性分析

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以线粒体Cytb基因作为分子标记对长江、淮河下游6个湖泊翘嘴鲌群体共262尾个体的遗传多样性、遗传分化及历史动态进行分析.结果显示,翘嘴鲌Cytn基因序列全长为1 141 bp,碱基A+T的含量(55.9％)高于G+C含量(44.1％).262条Cytb基因序列检出42个变异位点,定义46个单倍型,总群体单倍型和核苷酸多样性分别为0.916±0.010 和 0.00 256±0.00 008;6 个群体的单倍型多样性为(0.798±0.059)～(0.927±0.019),核苷酸多样性为(0.002 04±0.000 27)～(0.002 85±0.000 18),表明翘嘴鲌遗传多样性属于高Hd和低Pi模式.基于单倍型构建的系统发育树和进化网络图显示,6个群体的单倍型未形成明显的地理格局.分子方差分析(AMOVA)显示,遗传变异主要来自于群体内部(91.64％),群体间遗传分化系数(Fst)为0.083 62(P＜0.01);6个群体间的Fs,为-0.004 27～0.155 29,其中,长江群体和淮河群体间均具有显著中度或高度遗传分化(P＜0.05).中性检验结果显示,Tajima's D和Fu's Fs均为负值(P＜0.05),核苷酸不配对分布曲线呈现单峰型,表明翘嘴鲌群体在历史上经历过显著的种群扩张.整体来看,江淮下游湖泊的翘嘴鲌野生种质资源遗传多样性较低,长江水系群体和淮河水系群体间有显著的遗传分化,应采取措施恢复翘嘴鲌资源量及提高其遗传多样性,并将长江流域和淮河流域湖泊群体划分为不同的管理单元进行保护.

李大命、杨子萍、刘燕山、唐晟凯、谷先坤、殷稼雯

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江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室,江苏南京 210017

南京师范大学海洋科学与工程学院,江苏南京 210023

翘嘴鲌 Cytb基因 遗传多样性 遗传分化 种群历史动态

江苏省农业科技自主创新项目渔业生态与资源监测项目渔业生态与资源监测项目

CX2130032021-SJ-110-032022-SJ-061-02

2024

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.03.032

江苏农业科学
江苏省农业科学院

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CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2024.52(3)
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