江苏农业科学2024,Vol.52Issue(3) :213-220.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.03.032

基于线粒体Cytb基因的江淮下游6个湖泊翘嘴鲌群体遗传多样性分析

李大命 杨子萍 刘燕山 唐晟凯 谷先坤 殷稼雯
江苏农业科学2024,Vol.52Issue(3) :213-220.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.03.032

基于线粒体Cytb基因的江淮下游6个湖泊翘嘴鲌群体遗传多样性分析

李大命 1杨子萍 2刘燕山 1唐晟凯 1谷先坤 1殷稼雯1
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作者信息

  • 1. 江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室,江苏南京 210017
  • 2. 江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室,江苏南京 210017;南京师范大学海洋科学与工程学院,江苏南京 210023
  • 折叠

摘要

以线粒体Cytb基因作为分子标记对长江、淮河下游6个湖泊翘嘴鲌群体共262尾个体的遗传多样性、遗传分化及历史动态进行分析.结果显示,翘嘴鲌Cytn基因序列全长为1 141 bp,碱基A+T的含量(55.9%)高于G+C含量(44.1%).262条Cytb基因序列检出42个变异位点,定义46个单倍型,总群体单倍型和核苷酸多样性分别为0.916±0.010 和 0.00 256±0.00 008;6 个群体的单倍型多样性为(0.798±0.059)~(0.927±0.019),核苷酸多样性为(0.002 04±0.000 27)~(0.002 85±0.000 18),表明翘嘴鲌遗传多样性属于高Hd和低Pi模式.基于单倍型构建的系统发育树和进化网络图显示,6个群体的单倍型未形成明显的地理格局.分子方差分析(AMOVA)显示,遗传变异主要来自于群体内部(91.64%),群体间遗传分化系数(Fst)为0.083 62(P<0.01);6个群体间的Fs,为-0.004 27~0.155 29,其中,长江群体和淮河群体间均具有显著中度或高度遗传分化(P<0.05).中性检验结果显示,Tajima's D和Fu's Fs均为负值(P<0.05),核苷酸不配对分布曲线呈现单峰型,表明翘嘴鲌群体在历史上经历过显著的种群扩张.整体来看,江淮下游湖泊的翘嘴鲌野生种质资源遗传多样性较低,长江水系群体和淮河水系群体间有显著的遗传分化,应采取措施恢复翘嘴鲌资源量及提高其遗传多样性,并将长江流域和淮河流域湖泊群体划分为不同的管理单元进行保护.

关键词

翘嘴鲌/Cytb基因/遗传多样性/遗传分化/种群历史动态

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基金项目

江苏省农业科技自主创新项目(CX213003)

渔业生态与资源监测项目(2021-SJ-110-03)

渔业生态与资源监测项目(2022-SJ-061-02)

出版年

2024
江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
参考文献量33
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