玉米CBS基因家族的鉴定和特征分析

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中文摘要：为研究玉米CBS(ZmCBS)基因家族的特征，探讨其功能，对ZmCBS基因家族进行鉴定，分析其染色体定位、基因结构、保守结构域及进化关系，并对ZmCBS家族基因在玉米组织中的表达情况及其在非生物胁迫下的表达变化进行分析。基于玉米基因组数据库，鉴定到37个CBS基因家族成员，它们不均匀地分布在玉米的8条染色体上。该家族蛋白除保守的CBS结构域外，多数成员还包含其他结构域，包括电压门控的氯化物通道蛋白(voltage gated ClC)、Phox/Bemp1(PB1)结构域、五肱重复序列(penatricopeptider repeat，PPR)和E_SET结构域等。按照基因结构和进化关系可分为6个亚类，且同一进化分支上的基因具有相似的外显子结构和CDS长度，但内含子长度差异很大。启动子分析结果表明，ZmCBS基因启动子上含有响应激素和非生物胁迫的顺式作用元件。转录组数据的基因表达谱分析显示，ZmCBS基因家族部分成员在叶、花粉或胚中优势表达。ZmCBS3和ZmCBS14受冷胁迫诱导表达，ZmCBS14和ZmCBS22受干旱胁迫诱导表达，暗示这些基因在玉米响应外界胁迫中起重要作用。分析结果将为进一步研究ZmCBS家族基因奠定基础。

作者：

陈子强、李刚、颜静宛、郭新睿、胡昌泉、王月、王锋、田大刚

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作者单位：

福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室,福建福州 350003

关键词：

玉米 CBS基因家族生物信息学生物胁迫非生物胁迫特征分析

基金：

福建省科技计划公益类专项福建省科技计划公益类专项福建省农业高质量发展超越"5511"协同创新工程项目

项目编号：

2022R10270022021R1027001XTCXGC2021002

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.04.006

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(4)

参考文献量31