马铃薯响应低氮肥胁迫AP2转录因子的生物信息分析

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中文摘要：为研究马铃薯(Solanum tuberosum)AP2亚组类转录因子家族对低氮肥胁迫的响应特征，以马铃薯品种Russet Burbank为材料，分别种植于氮肥供应充足和不足条件下处理10 d后，收取不同处理下的叶片和根构建转录组测序文库，基于转录组测序结果筛选出AP2转录因子并对其进行生物信息分析和对低氮肥胁迫的响应分析。结果表明，18个马铃薯AP2转录因子不均匀地分布在11条染色体上，且都含有不同数目的保守基序结构，亲缘关系分析发现有15个马铃薯AP2家族蛋白与拟南芥的AP2蛋白聚集在了一起。基于马铃薯转录组数据，发现根中 12个基因在低氮肥胁迫处理后被抑制性表达，其中3个基因显著降低;在叶片中9个基因被抑制表达，2个基因达到了显著性差异。此外，还发现AP2转录因子在马铃薯不同组织中的表达水平有很大差异，其中 14个AP2转录因子在根和叶片中的表达量呈显著性差异。根据亲缘关系和功能分析，推测PGSC0003DMG400027502、PGSC0003DMG400012181和PGSC0003DMG400013587可作为候选的响应氮肥胁迫的关键转录因子，该研究为下一步研究马铃薯AP2响应低氮肥胁迫的生物学功能奠定了基础。

作者：

张珍华、蒋素华、武思、梁芳、牛苏燕

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作者单位：

郑州师范学院,河南郑州 450044

关键词：

马铃薯低氮肥胁迫 AP2转录因子生物信息学分析响应

基金：

河南省科技攻关计划河南省科技攻关计划郑州师范学院高层次人才科研启动专项

项目编号：

2021021101672121021102112018

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.04.008

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(4)

参考文献量31