江苏农业科学2024,Vol.52Issue(4) :55-62.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.04.008

马铃薯响应低氮肥胁迫AP2转录因子的生物信息分析

张珍华 蒋素华 武思 梁芳 牛苏燕
江苏农业科学2024,Vol.52Issue(4) :55-62.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.04.008

马铃薯响应低氮肥胁迫AP2转录因子的生物信息分析

张珍华 1蒋素华 1武思 1梁芳 1牛苏燕1
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  • 1. 郑州师范学院,河南郑州 450044
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摘要

为研究马铃薯(Solanum tuberosum)AP2亚组类转录因子家族对低氮肥胁迫的响应特征,以马铃薯品种Russet Burbank为材料,分别种植于氮肥供应充足和不足条件下处理10 d后,收取不同处理下的叶片和根构建转录组测序文库,基于转录组测序结果筛选出AP2转录因子并对其进行生物信息分析和对低氮肥胁迫的响应分析.结果表明,18个马铃薯AP2转录因子不均匀地分布在11条染色体上,且都含有不同数目的保守基序结构,亲缘关系分析发现有15个马铃薯AP2家族蛋白与拟南芥的AP2蛋白聚集在了一起.基于马铃薯转录组数据,发现根中 12个基因在低氮肥胁迫处理后被抑制性表达,其中3个基因显著降低;在叶片中9个基因被抑制表达,2个基因达到了显著性差异.此外,还发现AP2转录因子在马铃薯不同组织中的表达水平有很大差异,其中 14个AP2转录因子在根和叶片中的表达量呈显著性差异.根据亲缘关系和功能分析,推测PGSC0003DMG400027502、PGSC0003DMG400012181和PGSC0003DMG400013587可作为候选的响应氮肥胁迫的关键转录因子,该研究为下一步研究马铃薯AP2响应低氮肥胁迫的生物学功能奠定了基础.

关键词

马铃薯/低氮肥胁迫/AP2转录因子/生物信息学分析/响应

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基金项目

河南省科技攻关计划(202102110167)

河南省科技攻关计划(212102110211)

郑州师范学院高层次人才科研启动专项(2018)

出版年

2024
江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
被引量1
参考文献量31
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