水稻核糖体失活蛋白家族基因OsRIP8的生物信息学与功能分析

扫码查看

原文链接

万方数据
维普

中文摘要：核糖体失活蛋白(RIPs)是一种能使真核细胞核糖体功能被抑制的毒蛋白.OsRIP8是属于该家族的一个功能未知基因.为研究该基因生物学功能,通过数据库对其进行生物信息学分析,利用qRT-PCR验证其表达模式,同时构建OsRIP8-RNAi干涉载体并利用农杆菌转化水稻,采用PCR技术鉴定出转基因阳性植株,分析阳性植株的表达和农艺性状,初步揭示该基因的功能.结果表明,水稻OsRIP8蛋白为不稳定亲水蛋白,不含信号肽及完整的跨膜结构域,蛋白结构以α螺旋为主;在OsRIP8基因启动子区域存在着与植物生长发育、生物与非生物胁迫以及植物激素响应有关的元件;OsRIP8基因的共表达基因富集到多种大分子的生物合成与蛋白代谢等途径;qRT-PCR分析结果表明,OsRIP8基因在发育的小穗及抽穗前1 d的花药中优先表达;RNAi干涉后OsRIP8基因的表达下调造成植株花粉育性和结实率显著降低.暗示该基因对水稻小穗的发育具有重要作用,可能参与调控花粉发育过程.

作者：

徐娅、黄佑岗、李树杏

展开 >

作者单位：

贵州省农业科学院水稻研究所,贵州贵阳 550006

关键词：

水稻核糖体失活蛋白生物信息学分析功能分析基因表达

基金：

贵州省科技计划贵州省农科院青年科技基金贵州省科技计划贵州省水稻研究所青年基金

项目编号：

黔科合基础[2020]1Z020黔农科院青年基金[2019]01号黔科合支撑[2022]重点028号黔水稻所青年基金[2021]018号

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.04.010

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(4)

参考文献量26