江苏农业科学2024,Vol.52Issue(4) :71-79.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.04.010

水稻核糖体失活蛋白家族基因OsRIP8的生物信息学与功能分析

徐娅 黄佑岗 李树杏
江苏农业科学2024,Vol.52Issue(4) :71-79.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.04.010

水稻核糖体失活蛋白家族基因OsRIP8的生物信息学与功能分析

徐娅 1黄佑岗 1李树杏1
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作者信息

  • 1. 贵州省农业科学院水稻研究所,贵州贵阳 550006
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摘要

核糖体失活蛋白(RIPs)是一种能使真核细胞核糖体功能被抑制的毒蛋白.OsRIP8是属于该家族的一个功能未知基因.为研究该基因生物学功能,通过数据库对其进行生物信息学分析,利用qRT-PCR验证其表达模式,同时构建OsRIP8-RNAi干涉载体并利用农杆菌转化水稻,采用PCR技术鉴定出转基因阳性植株,分析阳性植株的表达和农艺性状,初步揭示该基因的功能.结果表明,水稻OsRIP8蛋白为不稳定亲水蛋白,不含信号肽及完整的跨膜结构域,蛋白结构以α螺旋为主;在OsRIP8基因启动子区域存在着与植物生长发育、生物与非生物胁迫以及植物激素响应有关的元件;OsRIP8基因的共表达基因富集到多种大分子的生物合成与蛋白代谢等途径;qRT-PCR分析结果表明,OsRIP8基因在发育的小穗及抽穗前1 d的花药中优先表达;RNAi干涉后OsRIP8基因的表达下调造成植株花粉育性和结实率显著降低.暗示该基因对水稻小穗的发育具有重要作用,可能参与调控花粉发育过程.

关键词

水稻/核糖体失活蛋白/生物信息学分析/功能分析/基因表达

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基金项目

贵州省科技计划(黔科合基础[2020]1Z020)

贵州省农科院青年科技基金(黔农科院青年基金[2019]01号)

贵州省科技计划(黔科合支撑[2022]重点028号)

贵州省水稻研究所青年基金(黔水稻所青年基金[2021]018号)

出版年

2024
江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
参考文献量26
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