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gga-miR-26a的组织特异性表达及其靶基因的预测分析

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为初步阐明gga-miR-26a在鸡脂肪沉积中的作用，以矮小品系S3系(DW)和隐性白羽鸡(RR)为试验素材，采用实时荧光定量PCR法检测gga-miR-26a在2个品种不同生长发育时期肝脏、腹脂及腿肌组织，腹脂和肌内脂肪细胞增殖期和分化期的表达变化，并利用生物信息学的方法，对gga-miR-26a靶基因进行预测和分析。结果表明，gga-miR-26a在S3系鸡(DW)和隐性白羽鸡(RR)16 W时肝脏组织中的表达存在显著的品种差异，S3系鸡在5个发育阶段表达均高于隐性白羽鸡;腹脂组织中，gga-miR-26a在0 W时存在极显著的品种差异(P＜0。01)且显著高于其他周龄;gga-miR-26a在腿肌组织中的表达无显著的品种差异(P＞0。05);在脂肪细胞中，gga-miR-26a在分化4 d的表达显著高于增殖期(P＜0。05)。利用TargetScan、miRDB、miRmap等3个软件对gga-miR-26a靶基因进行预测，共预测到163个交集靶基因;GO及KEGG分析提示gga-miR-26a可能通过靶向调节PTEN、ULK2和PRKCD的表达，进而调控鸡的脂肪沉积。综上所述，gga-miR-26a在2个品种鸡脂肪相关组织及脂肪细胞中均有表达，且具有显著的品种差异;gga-miR-26a参与了鸡的脂肪沉积过程，PTEN、ULK2和PRKCD可能是gga-miR-26a调控脂肪沉积的预测靶基因。

李瑞瑞、张子晓、赵振华、韩威、向海、王钱保、黄正洋、李春苗、宗毅、黄华云

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江苏省家禽科学研究所,江苏扬州 225125

佛山科学技术学院广东省动物分子设计与精准育种重点实验室,广东佛山 528225

河北科技师范大学,河北秦皇岛 066600

gga-miR-26a 鸡 表达特性 靶基因

现代农业产业技术体系建设专项江苏省种业振兴"揭榜挂帅"项目江苏省种业振兴"揭榜挂帅"项目国家家养动物种质库建设项目国家自然科学基金

CARS-41-Z05JBGS2021109JBGS2021029202332102538

2024

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.05.009

江苏农业科学
江苏省农业科学院

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CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2024.52(5)
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