江苏农业科学2024,Vol.52Issue(5) :64-69.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.05.009

gga-miR-26a的组织特异性表达及其靶基因的预测分析

李瑞瑞 张子晓 赵振华 韩威 向海 王钱保 黄正洋 李春苗 宗毅 黄华云
江苏农业科学2024,Vol.52Issue(5) :64-69.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.05.009

gga-miR-26a的组织特异性表达及其靶基因的预测分析

李瑞瑞 1张子晓 2赵振华 3韩威 3向海 4王钱保 4黄正洋 4李春苗 4宗毅 4黄华云3
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作者信息

  • 1. 江苏省家禽科学研究所,江苏扬州 225125;佛山科学技术学院广东省动物分子设计与精准育种重点实验室,广东佛山 528225
  • 2. 河北科技师范大学,河北秦皇岛 066600
  • 3. 江苏省家禽科学研究所,江苏扬州 225125
  • 4. 佛山科学技术学院广东省动物分子设计与精准育种重点实验室,广东佛山 528225
  • 折叠

摘要

为初步阐明gga-miR-26a在鸡脂肪沉积中的作用,以矮小品系S3系(DW)和隐性白羽鸡(RR)为试验素材,采用实时荧光定量PCR法检测gga-miR-26a在2个品种不同生长发育时期肝脏、腹脂及腿肌组织,腹脂和肌内脂肪细胞增殖期和分化期的表达变化,并利用生物信息学的方法,对gga-miR-26a靶基因进行预测和分析.结果表明,gga-miR-26a在S3系鸡(DW)和隐性白羽鸡(RR)16 W时肝脏组织中的表达存在显著的品种差异,S3系鸡在5个发育阶段表达均高于隐性白羽鸡;腹脂组织中,gga-miR-26a在0 W时存在极显著的品种差异(P<0.01)且显著高于其他周龄;gga-miR-26a在腿肌组织中的表达无显著的品种差异(P>0.05);在脂肪细胞中,gga-miR-26a在分化4 d的表达显著高于增殖期(P<0.05).利用TargetScan、miRDB、miRmap等3个软件对gga-miR-26a靶基因进行预测,共预测到163个交集靶基因;GO及KEGG分析提示gga-miR-26a可能通过靶向调节PTEN、ULK2和PRKCD的表达,进而调控鸡的脂肪沉积.综上所述,gga-miR-26a在2个品种鸡脂肪相关组织及脂肪细胞中均有表达,且具有显著的品种差异;gga-miR-26a参与了鸡的脂肪沉积过程,PTEN、ULK2和PRKCD可能是gga-miR-26a调控脂肪沉积的预测靶基因.

关键词

gga-miR-26a//表达特性/靶基因

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基金项目

现代农业产业技术体系建设专项(CARS-41-Z05)

江苏省种业振兴"揭榜挂帅"项目(JBGS2021109)

江苏省种业振兴"揭榜挂帅"项目(JBGS2021029)

国家家养动物种质库建设项目(2023)

国家自然科学基金(32102538)

出版年

2024
江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
参考文献量25
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