首页|红花Aux/IAA基因家族鉴定及盐胁迫响应分析

红花Aux/IAA基因家族鉴定及盐胁迫响应分析

扫码查看
原文链接
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
为了对红花Aux/IAA基因家族进行生物信息学分析，研究该基因在红花生长发育中的调控作用，利用生物信息学方法，在红花全基因组中鉴定出28个Aux/IAA基因。根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系，使用MEGA 7。0做出系统发育进化树。经理化性质分析，红花Aux/IAA蛋白为亲水性蛋白，且79％位于细胞核中，大多数红花Aux/IAA蛋白表现为偏酸性;经聚类分析，将红花Aux/IAA基因分为5个亚族。基因结构分析表明，所有基因均含有1～9个内含子。这些基因在红花的9条染色体上非均匀地分布，其中9号染色体上分布最多，有7个Aux/IAA基因。红花Aux/IA4基因在不同发育期及不同外源激素处理下表达量各不相同。对保守基序作图分析发现，大部分红花Aux/IAA蛋白具有4个共同的保守基序，分别为motif 1、motif 2、motif 3、motif 4，qRT-PCR结果表明，不同浓度盐胁迫处理24 h后，基因CtAux/IAA1相对表达量呈上调趋势，推测此基因可能与提高红花抗盐胁迫能力有关。本研究结果将有助于了解红花Aux/IAA基因家族在生长发育过程中的功能并筛选优良基因。

刘湘楠、胡祥祥、乔梦燚、周丹宁、朱畇昊

展开 >

河南中医药大学药学院,河南郑州 450046

呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心,河南郑州 450046

红花 Aux/IAA基因家族 生物信息学分析 盐胁迫

国家自然科学基金国家重点研发计划河南省科技重大专项河南省科技攻关计划

816032322017YFC1702800171100310500172102310539

2024

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.06.009

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2024.52(6)
  • 25