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桑属植物叶绿体基因组特征比较及系统发育分析

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探究桑属叶绿体基因组特征及该属物种的系统发育进化关系.收集8种桑属植物叶绿体基因序列,基于最大似然法重建桑属植物系统发育关系,并运用生物信息学手段进行叶绿体基因组特征分析.桑树叶绿体基因组结构为典型的四段式结构,大单拷贝区长89 952 bp,小单拷贝区长20 149 bp,2个反向重复区长25 751 bp.共检测到661个SSR位点,包含480个单核苷酸位点、57个二核苷酸位点、25个三核苷酸位点、82个四核苷酸位点、16个五核苷酸位点、1个六核苷酸位点,碱基组成以A/T碱基类型为主,平均GC含量为36.2％.变异度在前3位的间隔区依次是psbl-trnS(GCU)-trnG(UCC)、rps4-trnT(UGU)-trnL(UAA)、rp132-trnL(UAG).桑属树种的叶绿体基因组相对较大,且序列稳定,变异主要发生在LSC区.相较于基因编码区,桑属植物的基因非编码区更容易积累突变.桑与蒙桑具有较近的亲缘关系,其次是华桑与吉隆桑.

张浩蓉、秃玉翔、李启少、曹正英、赵文植、沈伟祥、孙正海

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西南林业大学园林园艺学院/国家林业和草原局西南风景园林工程技术研究中心,云南昆明 650224

桑属 叶绿体基因组 特征 系统发育

云南省科技人才与平台计划西南林业大学科研预研基金

202205AF150022

2024

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.07.005

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2024.52(7)
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