江苏农业科学2024,Vol.52Issue(9) :42-50.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.09.006

茶树GATA基因家族的全基因组鉴定及表达分析

青亚林 侯炳豪 张宇航 曾珊珊 高婷 叶乃兴
江苏农业科学2024,Vol.52Issue(9) :42-50.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.09.006

茶树GATA基因家族的全基因组鉴定及表达分析

青亚林 1侯炳豪 1张宇航 1曾珊珊 1高婷 1叶乃兴1
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作者信息

  • 1. 福建农林大学园艺学院,福建福州 350002
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摘要

植物转录因子GATA与靶基因启动子上的WGATAR序列结合,改变下游靶基因的转录,从而调控植物的生长发育.对茶树GATA转录因子的生物学信息特征进行鉴定与分析,为后续茶树栽培育种等相关研究提供理论依据.利用生物信息学方法及实时荧光定量PCR技术,对茶树GATA家族基因进行全基因组鉴定与表达分析.结果表明,(1)鉴定出的35个茶树GATA基因分布于13条染色体上,亚细胞定位预测主要在细胞核上.(2)系统进化分析将茶树GATA基因家族成员分为4个亚族.(3)茶树GATA启动子顺式作用元件分析显示,茶树GATA启动子上有许多光响应、激素信号响应与环境胁迫响应相关的元件.(4)组织特异性分析显示,GAL4基因在茶树不同组织中的表达模式有显著差异,多数基因在芽上具有较高的表达.(5)实时荧光定量PCR分析结果显示,在不同处理下,茶树GATA家族基因表达量总体呈下调趋势,其中CsGATA1表达量下调最显著.CsGATA对逆境胁迫响应敏感,说明CsGATA可能参与调控茶树不同生长发育过程,其中CsGATA1可能参与茶树生长发育及逆境胁迫响应的调控.

关键词

茶树/GATA基因家族/生物信息学/基因表达/全基因组鉴定

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基金项目

安溪茶叶重大科技创新专项(AX2021001)

福建张天福茶叶发展基金会科技创新基金(FJZTF01)

出版年

2024
江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
参考文献量18
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