茶树GATA基因家族的全基因组鉴定及表达分析

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中文摘要：植物转录因子GATA与靶基因启动子上的WGATAR序列结合，改变下游靶基因的转录，从而调控植物的生长发育。对茶树GATA转录因子的生物学信息特征进行鉴定与分析，为后续茶树栽培育种等相关研究提供理论依据。利用生物信息学方法及实时荧光定量PCR技术，对茶树GATA家族基因进行全基因组鉴定与表达分析。结果表明，(1)鉴定出的35个茶树GATA基因分布于13条染色体上，亚细胞定位预测主要在细胞核上。(2)系统进化分析将茶树GATA基因家族成员分为4个亚族。(3)茶树GATA启动子顺式作用元件分析显示，茶树GATA启动子上有许多光响应、激素信号响应与环境胁迫响应相关的元件。(4)组织特异性分析显示，GAL4基因在茶树不同组织中的表达模式有显著差异，多数基因在芽上具有较高的表达。(5)实时荧光定量PCR分析结果显示，在不同处理下，茶树GATA家族基因表达量总体呈下调趋势，其中CsGATA1表达量下调最显著。CsGATA对逆境胁迫响应敏感，说明CsGATA可能参与调控茶树不同生长发育过程，其中CsGATA1可能参与茶树生长发育及逆境胁迫响应的调控。

作者：

青亚林、侯炳豪、张宇航、曾珊珊、高婷、叶乃兴

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作者单位：

福建农林大学园艺学院,福建福州 350002

关键词：

茶树 GATA基因家族生物信息学基因表达全基因组鉴定

基金：

安溪茶叶重大科技创新专项福建张天福茶叶发展基金会科技创新基金

项目编号：

AX2021001FJZTF01

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.09.006

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(9)

参考文献量18