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滇龙胆C2H2基因家族鉴定及响应茉莉酸甲酯诱导表达分析

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滇龙胆(Gentiana rigescens)是龙胆药材的基源植物之一，C2H2锌指蛋白是锌指蛋白家族中的一个大家族，其成员在1年生滇龙胆转录中最为丰富，本研究拟在对滇龙胆转录组中C2H2基因家族进行鉴定并分析响应茉莉酸甲酯(MeJA)诱导表达模式，为滇龙胆C2H2转录因子功能研究提供参考。基于滇龙胆转录组数据，利用NCBI、MAFFT、MEME、STRING等在线网站及TBtools软件对其基因信息、进化关系、表达模式等进行分析。结果表明，从滇龙胆转录组中共鉴定出31个含有C2H2保守结构域的序列(GrC2H2 1～GrC2H2 31)，编码的氨基酸数量在53(GrC2H2 14)～604个(GrC2H2 31)之间，等电点介于4。23～9。92之间，且31个家族成员都定位在细胞核中，其家族分为 10 个亚家族，GrC2H2 5、GrC2H2 6、GrC2H2 8、GrC2H2 11、GrC2H2 17、GrC2H2 18、GrC2H2 19、GrC2H2 22、GrC2H2 23和GrC2H2 31共10个转录因子为滇龙胆C2H2转录因子的正调控因子。2种浓度MeJA诱导后C2H2表达模式显示，MeJA浓度越高，GrC2H2基因表达量越高。本研究首次鉴定了滇龙胆C2H2基因家族并分析了其响应MeJA表达模式，可为后续深入研究C2H2基因家族功能及滇龙胆优质品种的选育提供理论参考。

谷云霞、王梦琦、张婷、单李铭、刘小莉

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云南中医药大学中药学院,云南昆明 650500

滇龙胆 生物信息学 C2H2转录因子 基因表达 茉莉酸甲酯诱导

国家自然科学基金云南省科技厅-云南中医药大学联合专项云南省高等学校药用食用花卉科技创新团队项目科技创新基地建设项目

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2024

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.09.007

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2024.52(9)
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