枳PtrPP2C51基因克隆与非生物胁迫表达分析

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中文摘要：克隆枳PP2C基因家族的PtrPP2C51基因,分析其在低温、高温和干旱等胁迫下的表达规律,探究其在非生物胁迫中的功能.以1年生枳苗为试材,从嫩叶克隆到PtrPP2C51基因cDNA序列,采用生物信息学方法对其进行分析,利用实时荧光定量PCR仪(qRT-PCR)检测枳苗在低温、高温和干旱(15％PEG-6000)处理下的PtrPP2C51基因表达模式.克隆获得PtrPP2C51基因编码区CDS序列长度为879 bp,编码292个氨基酸,其蛋白分子量为31.36 ku,理论等电点4.9,脂肪系数79.52,不稳定系数39.57,亲水性平均值-0.279.PtrPP2C51蛋白的二级结构中α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲占比分别为40.07％、7.88％、18.15％和33.90％.PtrPP2C51蛋白与克里曼丁橘的PP2C蛋白在同一小分支上,亲缘关系最近.经低温(0℃)、高温(38℃)和干旱(15％PEG-6000)3种不同胁迫处理,PtrPP2C51基因的相对表达量均表现持续上调趋势,并且均在处理12 h时表达量达到最高值.PtrPP2C51基因可能参与枳的抗逆胁迫调控机制.

作者：

佟晓楠、胡文娟、杨杰、陈凯、董小筠、钟奕恬、张晓媛、李兴涛

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作者单位：

赣南师范大学生命科学学院/国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州 341000

关键词：

枳 PP2C基因基因克隆非生物胁迫

基金：

国家自然科学基金江西省教育厅科技项目

项目编号：

32160731GJJ2201233

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.10.006

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(10)