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百香果CBF基因家族鉴定与表达分析

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百香果(Passiflora edulis Sims)原产热带地区,对低温十分敏感.CBF(C-repeat binding factor)基因家族是AP2转录因子家族的一类成员,在植物应对低温、干旱和盐等非生物胁迫中发挥重要作用.对百香果CBF基因家族进行鉴定和分析,并探究其在低温胁迫下的表达模式,可为进一步研究百香果CBF基因功能提供重要的参考信息.采用生物信息学方法鉴定百香果CBF基因家族成员,并对家族成员的序列组分、理化性质、系统进化关系、染色体定位、基因结构、保守基序、启动子顺式作用元件和转录因子结合位点等进行分析,通过qRT-PCR方法分析其在低温胁迫下的表达模式.结果显示,百香果基因组中共有5个CBF基因家族成员,其中 3个分布在1号染色体上,2个分布在7号染色体上,被预测定位到细胞核、质膜和过氧化物酶体中;含有1～2个外显子,11～12个motif;系统进化显示5个百香果CBF基因、10个水稻CBF基因及6个拟南芥CBF基因共分成了 2大亚组:亚组Ⅰ中包括拟南芥的全部6个CBF基因、百香果的全部5个CBF基因和水稻的4个CBF基因,水稻剩下的6个CBF基因分到了亚组Ⅱ中;启动子区域含有25种顺式作用元件,以光响应、激素与逆境胁迫响应元件为主;共有20个转录因子结合位点;3个百香果CBF基因在低温胁迫下表达量极显著上升,推测上述基因参与了百香果低温胁迫响应.

梁宇尧、钟昌桦、潘若云、任锐、方庭

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福建农林大学园艺学院/福建农林大学园艺植物遗传育种研究所,福建福州 350002

百香果 CBF基因 低温胁迫 表达分析

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2021J05022zycxny2021010102/71201801101

2024

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.10.007

江苏农业科学
江苏省农业科学院

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CSTPCD北大核心
影响因子：0.732
ISSN：1002-1302
年,卷(期)：2024.52(10)