江苏农业科学2024,Vol.52Issue(12) :45-52.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.12.006

紫花苜蓿生长调节因子的全基因组鉴定及干旱胁迫下特征分析

孙龙飞 黄萍
江苏农业科学2024,Vol.52Issue(12) :45-52.DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.12.006

紫花苜蓿生长调节因子的全基因组鉴定及干旱胁迫下特征分析

孙龙飞 1黄萍1
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作者信息

  • 1. 河南农业职业学院园艺园林学院,河南郑州 450000
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摘要

为揭示紫花苜蓿(Medicago sativa)生长调节因子(GRF)响应干旱胁迫中的生理功能及响应机制,以劲能5020为试验材料,基于全基因组分析,对紫花苜蓿GRF家族成员进行鉴定和生物信息学分析,并采用RT-qPCR方法分析相关基因在干旱胁迫下的表达模式.结果表明,在紫花苜蓿中共鉴定出8个GRF编码基因的非冗余成员,可定位于7条染色体上.系统发育分析表明,紫花苜蓿GRF(MsGRF)可分为4个亚家族,同一亚家族的MsGRF都包含共同的高度保守基序、基因结构及多种顺式作用元件,表明MsGRF具有潜在的功能多样性.RNA-seq、qPCR表达模式表明,MsGRF在幼嫩组织和根系中具有较高的表达活性.RT-qPCR进一步表明,8个MsGRF成员中,6个基因(MsGRF1、MsGRF3、MsGRF5、MsGRF6、MsGRF7、MsGRF8)在干旱胁迫下上调表达,其中 MsGRF1 相对表达水平 45.8~83.1,表达活性最高、契合度最佳.综上,MsGRF在紫花苜蓿抗干旱过程中具有重要作用,推测MsGRF1是紫花苜蓿耐旱的关键基因.

关键词

紫花苜蓿/生长调节因子/全基因组/干旱胁迫/表达分析

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基金项目

河南省科技计划(182102110469)

出版年

2024
江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
参考文献量32
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