马铃薯StNiR基因的克隆及其在低氮肥胁迫下的表达分析

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中文摘要：为了研究马铃薯亚硝酸还原酶基因StNiR(nitrite reductase，NiR)在低氮肥胁迫中的作用，以马铃薯Russet Burbank品种为材料，采用反转录PCR法克隆获得马铃薯亚硝酸还原酶基因StNiR。结果表明，该基因的开放阅读框序列全长为1 755 bp，共编码584个氨基酸。蛋白质二级结构由36。82％a螺旋、5。31％β转角、16。78％延伸链和41。10％无规则卷曲组成，蛋白质三级结构与烟草NiR蛋白的一致性为86。60％。氨基酸序列与潘那利番茄(Solanum pennellii)、番茄(S。lycopericum)、曼陀罗(Datura stramonium)、风铃辣椒(Capsicum bacctum)、辣椒(C。annuum)、烟草(Nicotiana tabacum)的一致性均＞93％。微滴式数字PCR(droplet digital PCR，ddPCR)的结果与转录组测序结果表明，低氮肥胁迫下StNiR基因在根和叶片中均被抑制表达，且在根中比在叶片中更敏感。本研究为后期如何从分子角度提高马铃薯的氮素利用率和培育氮高效马铃薯新品种奠定了基础。

作者：

牛苏燕、张珍华、蒋素华、梁芳、袁秀云、张燕、赵慧园、崔波

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作者单位：

郑州师范学院,河南郑州 450044

关键词：

亚硝酸还原酶基因克隆生物信息分析微滴式数字PCR 马铃薯转录组测序

基金：

河南省科技攻关计划河南省高等学校重点科研项目郑州师范学院高层次人才科研启动专项经费

项目编号：

20210211016724A2100272018

出版年：

2024

DOI：

10.15889/j.issn.1002-1302.2024.14.006

江苏农业科学

江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心

影响因子：0.732

ISSN：1002-1302

年,卷(期)：2024.52(14)

参考文献量7