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烟草UGT92A1基因的全基因组鉴定和表达分析

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为探究尿苷二磷酸(uridine diphosphate,UDP)-依赖性糖基转移酶(UGT)在烟叶适应环境中的作用,以拟南芥UGT92A1基因为参考,对烟草、番茄、马铃薯的UGT92A1基因进行全基因组鉴定,随后对鉴定到的候选基因进行蛋白理化性质、系统进化、染色体定位、基因结构的分析。此外,通过顺式作用元件分析,以及对云烟87、韭菜坪2号这2个烟草品种的UGT92A1基因在达依、可乐、铁匠这3个烟叶产区的基因表达差异分析,预测烟草UGT92A1基因家族的关键基因成员。结果显示,从烟草、番茄、马铃薯中分别鉴定到9、2、7个同源基因,系统发育树将其按亲缘关系分为3组;基因结构分析显示,4个物种中 19个UGT92A1基因都具有UDPGT结构域,但结构域的结构和长度差异较大;顺式作用元件分析显示,烟草UGT92A1基因启动子区域含有大量光响应元件,此外还包含低温响应、缺氧诱导、干旱、创伤反应等非生物胁迫相关元件;转录组测序结果表明,NtUGT92A1-2、NtUGT92A1-7、NtUGT92A1-8这3个基因的表达量相对较高,且其表达均显著受烟叶产区的影响。综上,本研究在烟草中共鉴定到9个UGT92A1基因,其中NtUGT92A1-2、NtUGT92A1-7、NtUGT92A1-8这3个基因可能是烟草适应不同环境的关键基因,后续可进行深入研究。

张梦真、邱宇姗、黄赟、周遵华、马敏伦、陈德慧、马玉玺、赵会彦、李彩斌

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西南大学农学与生物科技学院,重庆 400715

贵州省烟草公司毕节市公司,贵州毕节 551700

烟草 UGT92A1 生物信息学 系统进化 表达分析

贵州省烟草公司毕节市公司2021年科技项目

2021520500240048

2024

江苏农业科学
江苏省农业科学院

江苏农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.732
ISSN:1002-1302
年,卷(期):2024.52(14)
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